120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3311 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3311  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
186 aa  364  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.629432  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4166  metal dependent phosphohydrolase  76.09 
 
 
186 aa  281  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.589554  hitchhiker  0.00675893 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1582  metal dependent phosphohydrolase  51.88 
 
 
192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.346306  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42027  predicted protein  44.53 
 
 
195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0156901  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0369  metal dependent phosphohydrolase  38.81 
 
 
157 aa  87  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0859  metal dependent phosphohydrolase  32.39 
 
 
177 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000211179 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3724  metal dependent phosphohydrolase  37.67 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463158  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04670  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
250 aa  80.1  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0368868  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0325  hypothetical protein  34.25 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.632910000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42834  predicted protein  30.57 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0852302  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06188  HD family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11680)  31.17 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0214661 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0400  metal dependent phosphohydrolase  36.11 
 
 
197 aa  74.3  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71248  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1543  hypothetical protein  34.23 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1745  hypothetical protein  33.56 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1514  HAD superfamily hydrolase  33.56 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1503  HAD superfamily hydrolase  33.56 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1657  hypothetical protein  33.56 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193031  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0710  metal-dependent phosphohydrolase  35.42 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4377  metal-dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482271  normal  0.0623525 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4894  metal-dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226039 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1724  hypothetical protein  33.56 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1538  hypothetical protein  33.56 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12451  predicted protein  34.23 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1692  hypothetical protein  33.56 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0727  metal-dependent phosphohydrolase  40.71 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.287945  normal  0.180988 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40220  hypothetical protein  40.14 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1339  metal dependent phosphohydrolase  31.54 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.616198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1802  hypothetical protein  33.56 
 
 
200 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3961  metal dependent phosphohydrolase  32.62 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4880  metal dependent phosphohydrolase  31.76 
 
 
222 aa  71.2  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0034  metal dependent phosphohydrolase  36.55 
 
 
199 aa  70.9  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0696  metal dependent phosphohydrolase  34.01 
 
 
193 aa  70.9  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3654  hypothetical protein  32.65 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0821  HD domain-containing protein  38.79 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128596  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0037  HD domain-containing protein  38.79 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0113242  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0944  HD domain-containing protein  38.79 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216088  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0851  HD domain-containing protein  38.79 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173041  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1584  HD domain-containing protein  38.79 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.236176  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3408  hypothetical protein  38.46 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2197  HD domain-containing protein  38.79 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000428773  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0199  metal dependent phosphohydrolase  38.13 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.225671  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0730  metal dependent phosphohydrolase  36.3 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.559359  normal  0.600109 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3416  metal-dependent phosphohydrolase  40.71 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.361337  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4952  metal dependent phosphohydrolase  40.71 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.764591  normal  0.0584281 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1607  metal-dependent phosphohydrolase  33.11 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5334  metal dependent phosphohydrolase  40.71 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.032702 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0647  metal dependent phosphohydrolase  33.93 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.493215  normal  0.274929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7944  metal dependent phosphohydrolase  30.82 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239905  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0429  metal dependent phosphohydrolase  39.44 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.267133  normal  0.110289 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3189  metal-dependent phosphohydrolase  37.96 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0145  metal dependent phosphohydrolase  36.76 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3433  metal dependent phosphohydrolase  39.17 
 
 
202 aa  64.7  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3513  metal dependent phosphohydrolase  37.96 
 
 
201 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  0.384612 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2960  metal dependent phosphohydrolase  35.83 
 
 
374 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0373  metal dependent phosphohydrolase  31.79 
 
 
196 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3043  metal dependent phosphohydrolase  30.2 
 
 
203 aa  61.6  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3664  metal-dependent phosphohydrolase  40.54 
 
 
203 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.585081  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3308  metal dependent phosphohydrolase  37.17 
 
 
202 aa  61.2  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3385  metal dependent phosphohydrolase  38.79 
 
 
209 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.777632  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2979  metal dependent phosphohydrolase  29.63 
 
 
193 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3021  metal dependent phosphohydrolase  29.63 
 
 
193 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0425017  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3216  HD superfamily metal-dependent phosphohydrolase  28.32 
 
 
197 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000003044  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2750  metal dependent phosphohydrolase  30.07 
 
 
196 aa  59.7  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117557 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1237  HD domain-containing protein  36.97 
 
 
388 aa  59.3  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3828  metal-dependent phosphohydrolase  38.26 
 
 
224 aa  58.9  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2176  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 
209 aa  58.2  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1178  metal dependent phosphohydrolase  35.37 
 
 
200 aa  58.2  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.30163  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1335  metal dependent phosphohydrolase  28.3 
 
 
184 aa  57.4  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0664485  normal  0.289844 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0276  HD domain-containing protein  31.03 
 
 
208 aa  56.6  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000537325  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5135  metal-dependent phosphohydrolase  36.28 
 
 
196 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0838  metal dependent phosphohydrolase  38.39 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0799  metal dependent phosphohydrolase  30.88 
 
 
210 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1222  metal dependent phosphohydrolase  32.59 
 
 
175 aa  54.7  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0635  metal dependent phosphohydrolase  36.89 
 
 
202 aa  54.7  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3325  hypothetical protein  31.9 
 
 
197 aa  53.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.453276  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0787  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
191 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3901  metal dependent phosphohydrolase  32.64 
 
 
202 aa  52.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0160  metal dependent phosphohydrolase  31.34 
 
 
176 aa  52.8  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0849  metal dependent phosphohydrolase  37.93 
 
 
202 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0579  metal dependent phosphohydrolase  29.5 
 
 
214 aa  52  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03649  predicted hydrolase  30.97 
 
 
196 aa  51.2  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3189  metal dependent phosphohydrolase  29.53 
 
 
209 aa  51.2  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2952  metal dependent phosphohydrolase  30.16 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0188  metal dependent phosphohydrolase  27.1 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5659  metal dependent phosphohydrolase  29.66 
 
 
243 aa  49.3  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.489267 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01921  hypothetical protein  34.26 
 
 
195 aa  48.9  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2224  metal dependent phosphohydrolase  32.33 
 
 
209 aa  48.5  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.143421 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5343  metal dependent phosphohydrolase  36.52 
 
 
207 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.734544  normal  0.114222 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2096  metal dependent phosphohydrolase  33.03 
 
 
205 aa  47.8  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2009  metal dependent phosphohydrolase  27.69 
 
 
206 aa  47.8  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343902  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0141  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  33.33 
 
 
208 aa  47.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0445  hypothetical protein  30.63 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1504  metal dependent phosphohydrolase  28.47 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.788309  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0514  HD superfamily hydrolase  34.35 
 
 
201 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1803  metal dependent phosphohydrolase  26.99 
 
 
196 aa  47.4  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0203013  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1931  metal dependent phosphohydrolase  33.08 
 
 
214 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000883588  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2098  hypothetical protein  30 
 
 
194 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272442  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003167  predicted hydrolase  34.55 
 
 
195 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0157  hypothetical protein  32.14 
 
 
201 aa  46.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01071  metal dependent phosphohydrolase  30.3 
 
 
199 aa  44.7  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>