118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3724 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3724  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 188 aa  390  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4894  metal-dependent phosphohydrolase  63.1 
 
 		 193 aa  249  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226039 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4377  metal-dependent phosphohydrolase  62.57 
 
 		 193 aa  249  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482271  normal  0.0623525 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0944  HD domain-containing protein  57.98 
 
 		 196 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216088  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0851  HD domain-containing protein  57.98 
 
 		 196 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173041  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1584  HD domain-containing protein  57.98 
 
 		 196 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.236176  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0821  HD domain-containing protein  57.98 
 
 		 234 aa  236  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128596  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2197  HD domain-containing protein  57.98 
 
 		 254 aa  236  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000428773  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0037  HD domain-containing protein  57.98 
 
 		 234 aa  236  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0113242  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40220  hypothetical protein  60.77 
 
 		 192 aa  234  7e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3408  hypothetical protein  59.56 
 
 		 192 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3664  metal-dependent phosphohydrolase  59.67 
 
 		 203 aa  225  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.585081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0727  metal-dependent phosphohydrolase  57.98 
 
 		 193 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.287945  normal  0.180988 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3416  metal-dependent phosphohydrolase  58.15 
 
 		 193 aa  218  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.361337  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4952  metal dependent phosphohydrolase  58.15 
 
 		 193 aa  218  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.764591  normal  0.0584281 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5334  metal dependent phosphohydrolase  58.15 
 
 		 193 aa  218  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.032702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0034  metal dependent phosphohydrolase  54.3 
 
 		 199 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0400  metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 		 197 aa  203  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71248  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0710  metal-dependent phosphohydrolase  51.61 
 
 		 197 aa  201  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3961  metal dependent phosphohydrolase  48.6 
 
 		 197 aa  181  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1745  hypothetical protein  35.45 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1802  hypothetical protein  35.45 
 
 		 200 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3654  hypothetical protein  35.45 
 
 		 200 aa  111  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1543  hypothetical protein  36.32 
 
 		 200 aa  111  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1692  hypothetical protein  35.45 
 
 		 200 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1514  HAD superfamily hydrolase  34.92 
 
 		 200 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1724  hypothetical protein  34.92 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1538  hypothetical protein  34.74 
 
 		 205 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1503  HAD superfamily hydrolase  34.74 
 
 		 200 aa  109  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1657  hypothetical protein  34.74 
 
 		 200 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193031  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1339  metal dependent phosphohydrolase  34.43 
 
 		 200 aa  109  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.616198  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2176  metal dependent phosphohydrolase  38.27 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5135  metal-dependent phosphohydrolase  36.62 
 
 		 196 aa  91.3  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3385  metal dependent phosphohydrolase  35.42 
 
 		 209 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.777632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2750  metal dependent phosphohydrolase  31.85 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117557 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3828  metal-dependent phosphohydrolase  36.62 
 
 		 224 aa  86.7  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42027  predicted protein  34.06 
 
 		 195 aa  85.5  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0156901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3189  metal-dependent phosphohydrolase  36.5 
 
 		 201 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3513  metal dependent phosphohydrolase  36.5 
 
 		 201 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  0.384612 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4880  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 		 222 aa  84.7  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003167  predicted hydrolase  29.76 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3216  HD superfamily metal-dependent phosphohydrolase  32.64 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000003044  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2960  metal dependent phosphohydrolase  33.54 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2098  hypothetical protein  32.68 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0445  hypothetical protein  32.05 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3311  metal dependent phosphohydrolase  37.67 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.629432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3043  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0141  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  35.33 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3522  HD superfamily metal-dependent phosphohydrolase  34.93 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.841823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0579  metal dependent phosphohydrolase  29.76 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0514  HD superfamily hydrolase  35.17 
 
 		 201 aa  77.8  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2366  HD superfamily hydrolase-like protein  31.08 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.61506 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1237  HD domain-containing protein  30.77 
 
 		 388 aa  75.9  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4166  metal dependent phosphohydrolase  40.58 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.589554  hitchhiker  0.00675893 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3433  metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42834  predicted protein  27.22 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0852302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01921  hypothetical protein  28.57 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0787  metal dependent phosphohydrolase  32.56 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3325  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.453276  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0838  metal dependent phosphohydrolase  32.56 
 
 		 191 aa  72  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0276  HD domain-containing protein  27.7 
 
 		 208 aa  71.2  0.000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000537325  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5343  metal dependent phosphohydrolase  31.76 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.734544  normal  0.114222 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0320  hypothetical protein  36.13 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03649  predicted hydrolase  30.41 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0696  metal dependent phosphohydrolase  32.87 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1582  metal dependent phosphohydrolase  35.14 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.346306  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0342  hypothetical protein  31.78 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0859  metal dependent phosphohydrolase  26.82 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000211179 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1504  metal dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.788309  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0849  metal dependent phosphohydrolase  29.09 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06188  HD family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11680)  27.42 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0214661 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0635  metal dependent phosphohydrolase  29.33 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2096  metal dependent phosphohydrolase  33.54 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3308  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0799  metal dependent phosphohydrolase  28.72 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3901  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 		 202 aa  62  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2224  metal dependent phosphohydrolase  32.62 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.143421 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1607  metal-dependent phosphohydrolase  31.03 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12451  predicted protein  28.66 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04670  conserved hypothetical protein  33.56 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0368868  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0373  metal dependent phosphohydrolase  32.14 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0188  metal dependent phosphohydrolase  29.01 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1931  metal dependent phosphohydrolase  35.07 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000883588  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0369  metal dependent phosphohydrolase  30.88 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0429  metal dependent phosphohydrolase  31.41 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.267133  normal  0.110289 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2009  metal dependent phosphohydrolase  27.82 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5659  metal dependent phosphohydrolase  29.52 
 
 		 243 aa  54.3  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.489267 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2952  metal dependent phosphohydrolase  28.38 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0325  hypothetical protein  29.77 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.632910000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2979  metal dependent phosphohydrolase  30.08 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3021  metal dependent phosphohydrolase  30.08 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0425017  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3189  metal dependent phosphohydrolase  26.52 
 
 		 209 aa  49.3  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0049  metal dependent phosphohydrolase  27.89 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1335  metal dependent phosphohydrolase  26.47 
 
 		 184 aa  48.1  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0664485  normal  0.289844 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2554  hypothetical protein  28.36 
 
 		 199 aa  47  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1390  hypothetical protein  27.27 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0691994  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1803  metal dependent phosphohydrolase  26.21 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0203013  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2359  metal dependent phosphohydrolase  24.83 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1584  metal dependent phosphohydrolase  26.24 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02216  hypothetical protein  25.71 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>