70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3233 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3233  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  404  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0639804  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2032  hypothetical protein  55.67 
 
 		 197 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004035  hypothetical protein  47.94 
 
 		 206 aa  185  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01426  hypothetical protein  48.45 
 
 		 215 aa  184  6e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1913  hypothetical protein  45.88 
 
 		 195 aa  180  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121835  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1390  hypothetical protein  46.7 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0691994  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2554  hypothetical protein  45.18 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1489  hypothetical protein  45.92 
 
 		 199 aa  175  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2775  hypothetical protein  45.92 
 
 		 199 aa  175  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3311  hypothetical protein  44.85 
 
 		 211 aa  172  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000439249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2680  hypothetical protein  45.41 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0592641  normal  0.884596 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2472  hypothetical protein  45.41 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0596343  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2560  hypothetical protein  45.41 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0453539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2572  hypothetical protein  45.41 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2517  hypothetical protein  45.41 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0323759  normal  0.485125 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2835  hypothetical protein  43.37 
 
 		 199 aa  172  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0310374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1564  hypothetical protein  44.85 
 
 		 233 aa  170  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02216  hypothetical protein  42.86 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2440  hypothetical protein  42.86 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1449  hypothetical protein  46.19 
 
 		 197 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1820  hypothetical protein  46.19 
 
 		 197 aa  169  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1557  hypothetical protein  46.19 
 
 		 197 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1361  hypothetical protein  42.86 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.516026 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2446  hypothetical protein  42.86 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3430  hypothetical protein  42.86 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.583869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02176  hypothetical protein  42.86 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1365  metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0524848  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2667  hypothetical protein  42.86 
 
 		 199 aa  167  9e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.623812  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2584  hypothetical protein  42.86 
 
 		 199 aa  167  9e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.187091  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2047  hypothetical protein  43.3 
 
 		 195 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00634487  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2265  hypothetical protein  42.05 
 
 		 195 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2041  hypothetical protein  42.27 
 
 		 195 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00953182  normal  0.0478039 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1934  hypothetical protein  42.27 
 
 		 195 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00115512  normal  0.0675072 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1906  hypothetical protein  43.3 
 
 		 195 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.233056  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2146  hypothetical protein  42.27 
 
 		 195 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137554  normal  0.0196393 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2484  hypothetical protein  42.78 
 
 		 195 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2359  metal dependent phosphohydrolase  44.04 
 
 		 205 aa  158  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4522  hypothetical protein  41.24 
 
 		 195 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2236  hypothetical protein  41.24 
 
 		 195 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1696  hypothetical protein  42.05 
 
 		 195 aa  157  8e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.102528  decreased coverage  0.00914575 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2185  hypothetical protein  41.24 
 
 		 195 aa  157  8e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0727923  hitchhiker  0.000447096 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2135  hypothetical protein  41.24 
 
 		 195 aa  157  8e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000415566  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2249  hypothetical protein  41.24 
 
 		 195 aa  157  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000105341  hitchhiker  0.0000000380351 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1871  hypothetical protein  41.24 
 
 		 195 aa  156  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.948658  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2345  hypothetical protein  40.21 
 
 		 195 aa  156  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267418  hitchhiker  0.000000795999 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1994  hypothetical protein  41.75 
 
 		 195 aa  155  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000122059  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0157  hypothetical protein  39.58 
 
 		 201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01071  metal dependent phosphohydrolase  40.82 
 
 		 199 aa  151  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0049  metal dependent phosphohydrolase  40.82 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0827  hypothetical protein  40.41 
 
 		 195 aa  149  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.315099  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0292  metal dependent phosphohydrolase  38.14 
 
 		 205 aa  142  2e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.496578  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1803  metal dependent phosphohydrolase  37.37 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0203013  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1584  metal dependent phosphohydrolase  36.27 
 
 		 202 aa  134  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0261  metal dependent phosphohydrolase  37.11 
 
 		 193 aa  128  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1070  metal dependent phosphohydrolase  36.92 
 
 		 202 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01268  hypothetical protein  33.16 
 
 		 217 aa  122  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42865  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3739  metal dependent phosphohydrolase  36.84 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0131  putative 5'-nucleotidase  32.29 
 
 		 201 aa  97.8  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2033  putative alpha helix protein  50.55 
 
 		 108 aa  89.4  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2017  putative phosphohydrolase  31.71 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0380  HD superfamily hydrolase  26.37 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.535161  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0423  HD domain-containing protein  26.36 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0797  metal-dependent phosphohydrolase  27.13 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0780  metal dependent phosphohydrolase  27.13 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.351982  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0381  HD superfamily hydrolase-like protein  23.53 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7944  metal dependent phosphohydrolase  26.38 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0859  metal dependent phosphohydrolase  30.11 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000211179 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0647  metal dependent phosphohydrolase  27.5 
 
 		 178 aa  42  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.493215  normal  0.274929 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0369  metal dependent phosphohydrolase  32.86 
 
 		 157 aa  42  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0696  metal dependent phosphohydrolase  22.22 
 
 		 193 aa  41.6  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>