63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01268 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01268  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  454  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42865  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004035  hypothetical protein  37.56 
 
 
206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1564  hypothetical protein  38.89 
 
 
233 aa  138  7e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01426  hypothetical protein  37.06 
 
 
215 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2554  hypothetical protein  37.13 
 
 
199 aa  134  8e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2032  hypothetical protein  37.82 
 
 
197 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1449  hypothetical protein  38.02 
 
 
197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1820  hypothetical protein  38.02 
 
 
197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1557  hypothetical protein  38.02 
 
 
197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3311  hypothetical protein  36.04 
 
 
211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000439249  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1489  hypothetical protein  37.63 
 
 
199 aa  131  6.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1390  hypothetical protein  37.31 
 
 
199 aa  131  6.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0691994  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1913  hypothetical protein  38.07 
 
 
195 aa  131  9e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121835  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2265  hypothetical protein  37.06 
 
 
195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.693233  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01071  metal dependent phosphohydrolase  37.95 
 
 
199 aa  128  6e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2835  hypothetical protein  36.55 
 
 
199 aa  128  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0310374  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0827  hypothetical protein  39.58 
 
 
195 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.315099  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1361  hypothetical protein  36.04 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.516026 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2446  hypothetical protein  36.04 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863522  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2440  hypothetical protein  36.04 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02216  hypothetical protein  36.04 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3430  hypothetical protein  36.04 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.583869  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02176  hypothetical protein  36.04 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2775  hypothetical protein  36.08 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1365  metal dependent phosphohydrolase  35.53 
 
 
199 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0524848  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2667  hypothetical protein  36.04 
 
 
199 aa  126  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.623812  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2584  hypothetical protein  36.04 
 
 
199 aa  126  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.187091  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2345  hypothetical protein  36.55 
 
 
195 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267418  hitchhiker  0.000000795999 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2047  hypothetical protein  37.06 
 
 
195 aa  125  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00634487  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2680  hypothetical protein  35.68 
 
 
199 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0592641  normal  0.884596 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2472  hypothetical protein  35.68 
 
 
199 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0596343  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2560  hypothetical protein  35.68 
 
 
199 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0453539  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2572  hypothetical protein  35.68 
 
 
199 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2517  hypothetical protein  35.68 
 
 
199 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0323759  normal  0.485125 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3233  hypothetical protein  33.16 
 
 
197 aa  122  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0639804  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0157  hypothetical protein  36.65 
 
 
201 aa  119  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1803  metal dependent phosphohydrolase  34.85 
 
 
196 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0203013  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1070  metal dependent phosphohydrolase  37.57 
 
 
202 aa  117  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4522  hypothetical protein  36.55 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2236  hypothetical protein  36.55 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2135  hypothetical protein  36.55 
 
 
195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000415566  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2249  hypothetical protein  36.55 
 
 
195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000105341  hitchhiker  0.0000000380351 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2185  hypothetical protein  36.55 
 
 
195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0727923  hitchhiker  0.000447096 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1871  hypothetical protein  36.55 
 
 
195 aa  116  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.948658  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1994  hypothetical protein  35.03 
 
 
195 aa  116  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000122059  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1696  hypothetical protein  35.53 
 
 
195 aa  116  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.102528  decreased coverage  0.00914575 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1906  hypothetical protein  35.03 
 
 
195 aa  112  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.233056  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2041  hypothetical protein  34.52 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00953182  normal  0.0478039 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2484  hypothetical protein  34.52 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1934  hypothetical protein  34.52 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00115512  normal  0.0675072 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2146  hypothetical protein  34.52 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137554  normal  0.0196393 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0049  metal dependent phosphohydrolase  33.85 
 
 
205 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0292  metal dependent phosphohydrolase  33.51 
 
 
205 aa  108  5e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.496578  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2359  metal dependent phosphohydrolase  32.46 
 
 
205 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0261  metal dependent phosphohydrolase  30.53 
 
 
193 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1584  metal dependent phosphohydrolase  33.16 
 
 
202 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3739  metal dependent phosphohydrolase  30.16 
 
 
195 aa  86.3  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0131  putative 5'-nucleotidase  30.32 
 
 
201 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2017  putative phosphohydrolase  37.3 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0083  HD superfamily hydrolase  26.18 
 
 
214 aa  56.2  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000142377  normal  0.689622 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2033  putative alpha helix protein  35.71 
 
 
108 aa  55.8  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0381  HD superfamily hydrolase-like protein  24.71 
 
 
212 aa  46.2  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0380  HD superfamily hydrolase  26.98 
 
 
217 aa  42.7  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.535161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>