More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3655 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3655  pilin, putative  100 
 
 		 186 aa  382  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  86.86 
 
 		 187 aa  320  7e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  82.26 
 
 		 187 aa  319  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  86.29 
 
 		 187 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  86.29 
 
 		 187 aa  318  3e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  82.87 
 
 		 180 aa  315  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  66.86 
 
 		 178 aa  241  6e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  62.71 
 
 		 187 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  61.02 
 
 		 186 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  62.22 
 
 		 185 aa  228  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3690  methylation site containing protein  53.71 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3316  methylation site containing protein  54.02 
 
 		 177 aa  178  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.192216  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3092  methylation site containing protein  51.15 
 
 		 186 aa  136  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.751451  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2521  hypothetical protein  35.48 
 
 		 193 aa  99  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  40.83 
 
 		 197 aa  88.2  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  42.19 
 
 		 191 aa  87.8  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  40.16 
 
 		 189 aa  87.8  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  41.41 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3866  hypothetical protein  41.41 
 
 		 191 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  39.84 
 
 		 192 aa  84.7  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01338  hypothetical protein  31.75 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  51.35 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4570  MSHA pilin protein MshB  33.33 
 
 		 229 aa  78.2  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527275  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4159  hypothetical protein  37.63 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0176  prepilin-type cleavage/methylation  30.6 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0435  methylation site containing protein  42.37 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3520  methylation site containing protein  42.37 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  34 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3698  methylation site containing protein  41.46 
 
 		 192 aa  72  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.452925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  51.39 
 
 		 108 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170582 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2151  membrane protein  29.75 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  52.24 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0552  MSHA pilin protein MshA  50.7 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00386307  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3464  hypothetical protein  60.71 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0907  hypothetical protein  60.71 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  60.71 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0898  hypothetical protein  60.71 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  58.93 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  29.05 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000424061  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  33.06 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0516  methylation site containing protein  40 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00623258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4411  methylation site containing protein  33.33 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000316241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0759  hypothetical protein  32.39 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0153764  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3745  methylation site containing protein  34.43 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403042  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  41.43 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0573  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  58.93 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.200044 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3762  methylation site containing protein  32.79 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000262752  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  55.36 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4409  methylation site containing protein  43.62 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  50.59 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  55.38 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  47.37 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0514  MSHA pilin protein MshB  31.98 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00061527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3829  MSHA pilin protein MshB  31.98 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175672  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  47.37 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000795599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0397  methylation site containing protein  42.55 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.061774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  47.37 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0568  methylation site containing protein  62.26 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238644  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0490  MSHA pilin protein MshB  45 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000965015  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3266  methylation site containing protein  32.89 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3478  methylation site containing protein  57.14 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000141512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3480  methylation site containing protein  47.37 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000493749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0511  MSHA pilin protein MshB  45 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000086206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  38.64 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3760  methylation site containing protein  56.14 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000143336  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3444  methylation site containing protein  32.28 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280491 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0515  methylation site containing protein  53.85 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000372661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4410  methylation site containing protein  53.85 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1101  methylation site containing protein  32.24 
 
 		 167 aa  62  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000943511 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  47.54 
 
 		 163 aa  62  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  69.23 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  69.23 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4408  MSHA pilin protein MshA  41.84 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00456827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3341  methylation  45.61 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000885834  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3308  methylation site containing protein  42.05 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0461  MSHA pilin protein MshA  56.6 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0491  methylation site containing protein  57.41 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000497616  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  57.41 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258454  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  53.45 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000294883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  53.45 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0460  MSHA pilin protein MshB  42.11 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0364  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  55.1 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0735599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  60.47 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3296  methylation site containing protein  56.14 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0473  methylation site containing protein  50.77 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  53.45 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0512  methylation site containing protein  57.41 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000175657  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  56.6 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3340  methylation  57.41 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000827612  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3744  methylation site containing protein  42.57 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144711  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3761  MSHA pilin protein MshA  38.61 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000202365  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1176  hypothetical protein  50.85 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3822  putative V10 pilin  41.67 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4105  MSHA pilin protein MshA  50.77 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3828  methylation site containing protein  53.7 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0366  N-terminal methylation  46.27 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02523  hypothetical protein  61.9 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003563  type II secretory pathway pseudopilin PulG  44.64 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1827  methylation site containing protein  44.07 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00097264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2860  methylation site containing protein  46.77 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>