172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2629 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 277 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1190  hypothetical protein  78.34 
 
 		 277 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2852  NAD-dependent epimerase/dehydratase  77.26 
 
 		 277 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.29 
 
 		 293 aa  135  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0363695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0464  UDP-glucose 4-epimerase  24.4 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0781477  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  27.78 
 
 		 327 aa  54.3  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  25.51 
 
 		 329 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.59 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  30.56 
 
 		 328 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1224  UDP-glucose 4-epimerase  26.18 
 
 		 328 aa  52.8  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00236591  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  27.33 
 
 		 326 aa  52.8  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0168  UDP-glucose 4-epimerase  29.41 
 
 		 342 aa  52.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.62 
 
 		 334 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  24.91 
 
 		 330 aa  52.4  0.000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  24.91 
 
 		 330 aa  52.4  0.000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  29.11 
 
 		 330 aa  52  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.7 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0248885  hitchhiker  0.0015787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  28.92 
 
 		 318 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1618  UDP-galactose 4-epimerase  27.84 
 
 		 350 aa  51.2  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.97 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  28.78 
 
 		 328 aa  50.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.35 
 
 		 313 aa  50.1  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  26.96 
 
 		 327 aa  50.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.58 
 
 		 333 aa  49.7  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5661  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.76 
 
 		 329 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  28.96 
 
 		 334 aa  49.7  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 		 317 aa  49.3  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  24.77 
 
 		 333 aa  49.3  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  23.96 
 
 		 325 aa  49.3  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  26.98 
 
 		 329 aa  49.3  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.21 
 
 		 310 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1815  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.06 
 
 		 349 aa  49.3  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  29.76 
 
 		 328 aa  48.9  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  29.76 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  28.64 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3929  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.68 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  27.99 
 
 		 329 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  28.25 
 
 		 327 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  33.75 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1700  NDP-hexose epimerase/oxydoreductase  33.33 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.356198  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  28.41 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  26.36 
 
 		 326 aa  47.8  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  28.25 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2973  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.24 
 
 		 326 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.4 
 
 		 310 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.37 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0943322  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  35.12 
 
 		 330 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05730  UDP-galactose 4-epimerase  31.68 
 
 		 333 aa  47.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.805791  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 		 324 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.64 
 
 		 326 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.64 
 
 		 331 aa  46.6  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.478693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  28.42 
 
 		 333 aa  46.6  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44740  UDP-glucose 4-epimerase  32.32 
 
 		 352 aa  46.6  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  32.2 
 
 		 332 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.71 
 
 		 308 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  27.69 
 
 		 319 aa  46.6  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.02 
 
 		 309 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3022  UDP-glucose 4-epimerase  28.05 
 
 		 349 aa  46.6  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  27.94 
 
 		 330 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.13 
 
 		 315 aa  46.2  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325994  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72000  oxidoreductase Rmd  35.1 
 
 		 304 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.65 
 
 		 312 aa  45.8  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  28.42 
 
 		 328 aa  45.8  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  26.02 
 
 		 336 aa  45.8  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  25.1 
 
 		 330 aa  45.8  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1573  UDP-glucose 4-epimerase  33.73 
 
 		 328 aa  45.8  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.95776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.39 
 
 		 323 aa  45.4  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.473487  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1259  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.29 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45434  nad-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 		 364 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.172272  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1597  UDP-glucose 4-epimerase  29.83 
 
 		 337 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.903427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4789  UDP-galactose 4-epimerase  28.57 
 
 		 329 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  25.57 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6506  UDP-glucose 4-epimerase  33.71 
 
 		 326 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4875  UDP-galactose 4-epimerase  28.57 
 
 		 329 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.1 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  27.03 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0368  UDP-glucose 4-epimerase  26.72 
 
 		 323 aa  45.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  27.94 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  31.15 
 
 		 321 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  26.73 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1866  UDP-glucose 4-epimerase  32.26 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 		 317 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3275  UDP-galactose 4-epimerase  32.56 
 
 		 333 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.768237  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  26.51 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4123  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.52 
 
 		 358 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.970471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.52 
 
 		 358 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0160562  normal  0.607841 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.73 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1401  UDP-glucose 4-epimerase  27.93 
 
 		 325 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3907  UDP-glucose 4-epimerase  26.28 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.179551 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  28.21 
 
 		 328 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0634  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.44 
 
 		 346 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133207  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1427  UDP-glucose 4-epimerase  27.78 
 
 		 337 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  29.76 
 
 		 661 aa  43.5  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  34.12 
 
 		 330 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>