96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2852 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2852  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 277 aa  524  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1190  hypothetical protein  98.19 
 
 		 277 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  77.26 
 
 		 277 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.52 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0363695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3929  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.55 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  26.74 
 
 		 333 aa  54.3  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  31.4 
 
 		 324 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  32.73 
 
 		 320 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.74 
 
 		 301 aa  52.4  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  28.1 
 
 		 328 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  30.58 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  30.58 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0368  UDP-glucose 4-epimerase  27.64 
 
 		 323 aa  50.8  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  26.29 
 
 		 318 aa  49.7  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  30.33 
 
 		 328 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.12 
 
 		 314 aa  49.7  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  25.31 
 
 		 328 aa  48.9  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  29.38 
 
 		 328 aa  48.9  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 		 308 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  33.05 
 
 		 320 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  32.29 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72000  oxidoreductase Rmd  31.68 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05730  UDP-galactose 4-epimerase  29.48 
 
 		 333 aa  47.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.805791  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  25.15 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.03 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3022  UDP-glucose 4-epimerase  29.05 
 
 		 349 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  27.59 
 
 		 327 aa  47  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  23.66 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  33.61 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  25.61 
 
 		 334 aa  47  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  35.35 
 
 		 329 aa  46.2  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  28.85 
 
 		 337 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  25 
 
 		 325 aa  46.2  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  23.04 
 
 		 337 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  26.2 
 
 		 328 aa  46.2  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 		 282 aa  46.2  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148906 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  25.82 
 
 		 331 aa  46.2  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  28.26 
 
 		 327 aa  46.2  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  31.03 
 
 		 331 aa  45.8  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  26.2 
 
 		 328 aa  45.8  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  25.79 
 
 		 329 aa  45.8  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  25.65 
 
 		 332 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  27.08 
 
 		 330 aa  45.4  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2296  UDP-glucose 4-epimerase  33.64 
 
 		 332 aa  45.8  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0685496  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.94 
 
 		 331 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  25.97 
 
 		 328 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1718  UDP-glucose 4-epimerase  32.56 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.818272  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.38 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1626  UDP-galactose 4-epimerase  28.49 
 
 		 331 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1401  UDP-glucose 4-epimerase  27.92 
 
 		 325 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3495  UDP-glucose 4-epimerase  28.57 
 
 		 322 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  24.88 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  29.94 
 
 		 324 aa  43.9  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 		 334 aa  43.9  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.225556  normal  0.379661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.48 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  23.83 
 
 		 331 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  31.4 
 
 		 327 aa  43.9  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  25.96 
 
 		 327 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.48 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6506  UDP-glucose 4-epimerase  31.61 
 
 		 326 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.29 
 
 		 302 aa  43.1  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  29.63 
 
 		 327 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  25.75 
 
 		 328 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0464  UDP-glucose 4-epimerase  21.65 
 
 		 327 aa  43.5  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0781477  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1224  UDP-glucose 4-epimerase  26.67 
 
 		 328 aa  43.5  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00236591  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1866  UDP-glucose 4-epimerase  29.66 
 
 		 330 aa  43.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2760  UDP-galactose 4-epimerase  30.91 
 
 		 330 aa  43.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.467809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  34.41 
 
 		 327 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6244  oxidoreductase Rmd  28.97 
 
 		 303 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  34.41 
 
 		 327 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  27.39 
 
 		 351 aa  43.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.82 
 
 		 331 aa  43.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.478693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  31.01 
 
 		 329 aa  42.7  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  28.85 
 
 		 324 aa  42.7  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  30.58 
 
 		 332 aa  42.7  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  27.27 
 
 		 323 aa  42.7  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  27.05 
 
 		 328 aa  42.7  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.97 
 
 		 322 aa  42.7  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3275  UDP-galactose 4-epimerase  28.48 
 
 		 333 aa  42.7  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.768237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.43 
 
 		 309 aa  42.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3917  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.48 
 
 		 284 aa  42.7  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0252378 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.81 
 
 		 281 aa  42.7  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.861168  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 311 aa  42.7  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 		 323 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.473487  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27520  UDP-galactose 4-epimerase  28.07 
 
 		 321 aa  42.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2509  UDP-glucose 4-epimerase  26.4 
 
 		 329 aa  42.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  31.43 
 
 		 329 aa  42.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  26.76 
 
 		 307 aa  42.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5711  GDP-4-dehydro-6-deoxy-D-mannose epimerase /GDP-4-dehydro-6-L-deoxygalactose reductase  24.21 
 
 		 316 aa  42.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 		 312 aa  42.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  27.11 
 
 		 327 aa  42.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.49 
 
 		 353 aa  42  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  29.85 
 
 		 324 aa  42  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.51 
 
 		 311 aa  42  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>