87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1190 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1190  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  524  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2852  NAD-dependent epimerase/dehydratase  98.19 
 
 		 277 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  78.34 
 
 		 277 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.87 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0363695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3929  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.55 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  33.33 
 
 		 324 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  26.74 
 
 		 333 aa  52.4  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  28.44 
 
 		 328 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  32.35 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.34 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  35.11 
 
 		 320 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  31.09 
 
 		 321 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  32.38 
 
 		 329 aa  50.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.28 
 
 		 301 aa  50.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  27.27 
 
 		 318 aa  49.3  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  30.33 
 
 		 328 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0368  UDP-glucose 4-epimerase  27.59 
 
 		 323 aa  48.5  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148906 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  33.9 
 
 		 328 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  25.79 
 
 		 328 aa  47.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05730  UDP-galactose 4-epimerase  29.48 
 
 		 333 aa  47.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.805791  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  34 
 
 		 320 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  25.61 
 
 		 326 aa  47  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  25.61 
 
 		 334 aa  47  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 		 308 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1866  UDP-glucose 4-epimerase  32.38 
 
 		 330 aa  46.2  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1401  UDP-glucose 4-epimerase  28.72 
 
 		 325 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  33.61 
 
 		 328 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  27.92 
 
 		 327 aa  46.2  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  30 
 
 		 337 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  30 
 
 		 337 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  31.03 
 
 		 331 aa  45.8  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.76 
 
 		 309 aa  45.8  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  27.23 
 
 		 330 aa  45.8  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3022  UDP-glucose 4-epimerase  29.05 
 
 		 349 aa  45.8  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  37.65 
 
 		 329 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  28.68 
 
 		 327 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  23.66 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  24.79 
 
 		 325 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  26.11 
 
 		 331 aa  45.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1718  UDP-glucose 4-epimerase  32.56 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.818272  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  26.19 
 
 		 329 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3495  UDP-glucose 4-epimerase  28.57 
 
 		 322 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2296  UDP-glucose 4-epimerase  33.64 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0685496  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  26.67 
 
 		 328 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  26.67 
 
 		 328 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  26.32 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 		 312 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  25.65 
 
 		 332 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72000  oxidoreductase Rmd  32.93 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  30.59 
 
 		 328 aa  43.5  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.38 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  25.24 
 
 		 328 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  27.39 
 
 		 351 aa  43.5  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  26 
 
 		 329 aa  43.9  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4875  UDP-galactose 4-epimerase  26.18 
 
 		 329 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 		 334 aa  43.9  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.225556  normal  0.379661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 		 310 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4789  UDP-galactose 4-epimerase  26.18 
 
 		 329 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 311 aa  43.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  34.41 
 
 		 327 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  34.41 
 
 		 327 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.81 
 
 		 281 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.861168  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.58 
 
 		 331 aa  43.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.478693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  29.63 
 
 		 327 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  26.14 
 
 		 336 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.5 
 
 		 292 aa  43.1  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  28.05 
 
 		 327 aa  43.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.42 
 
 		 331 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 		 323 aa  42.7  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.473487  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.97 
 
 		 322 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  30.58 
 
 		 332 aa  42.7  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6506  UDP-glucose 4-epimerase  36.36 
 
 		 326 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 		 310 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  31.01 
 
 		 329 aa  42.7  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  23.32 
 
 		 331 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein/3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  34.3 
 
 		 330 aa  42.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27520  UDP-galactose 4-epimerase  28.07 
 
 		 321 aa  42.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0464  UDP-glucose 4-epimerase  21.65 
 
 		 327 aa  42.4  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0781477  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 		 310 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  27.62 
 
 		 329 aa  42.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.29 
 
 		 302 aa  42.4  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2760  UDP-galactose 4-epimerase  31.68 
 
 		 330 aa  42.4  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.467809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  27.5 
 
 		 328 aa  42  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  30.51 
 
 		 356 aa  42  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  28.21 
 
 		 323 aa  42  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2509  UDP-glucose 4-epimerase  26.4 
 
 		 329 aa  42  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>