52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0811 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0811  protein of unknown function DUF1468  100 
 
 		 161 aa  313  7e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0794  hypothetical protein  87.58 
 
 		 161 aa  231  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0741  protein of unknown function DUF1468  96.05 
 
 		 152 aa  213  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48344  normal  0.546388 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  66.44 
 
 		 164 aa  197  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0826  hypothetical protein  65.56 
 
 		 153 aa  170  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445007 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3643  hypothetical protein  67.11 
 
 		 153 aa  166  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.025791  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0845  hypothetical protein  65.56 
 
 		 153 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  46.98 
 
 		 152 aa  148  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1438  protein of unknown function DUF1468  49.66 
 
 		 153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.832604 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5394  hypothetical protein  41.14 
 
 		 162 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2746  protein of unknown function DUF1468  39.87 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1250  protein of unknown function DUF1468  39.87 
 
 		 162 aa  110  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4019  hypothetical protein  36.47 
 
 		 191 aa  107  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0318  protein of unknown function DUF1468  38.61 
 
 		 162 aa  107  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3238  hypothetical protein  40.51 
 
 		 162 aa  107  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3881  hypothetical protein  41.25 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1069  hypothetical protein  43.83 
 
 		 162 aa  103  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3412  hypothetical protein  41.14 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3057  hypothetical protein  43.42 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.542424 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2305  hypothetical protein  44 
 
 		 154 aa  95.5  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6377  protein of unknown function DUF1468  43.4 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3213  hypothetical protein  41.14 
 
 		 163 aa  90.1  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  32.87 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2564  protein of unknown function DUF1468  37.5 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2919  hypothetical protein  29.33 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169398  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3458  protein of unknown function DUF1468  37.31 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0197428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3167  protein of unknown function DUF1468  38.81 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4103  hypothetical protein  34.92 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3223  hypothetical protein  31.54 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908a  hypothetical protein  28.75 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2146  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  32.43 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3250  hypothetical protein  28.28 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1331  hypothetical protein  38.97 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0554  hypothetical protein  34.62 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0414  hypothetical protein  30.06 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7082  hypothetical protein  29.66 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4403  hypothetical protein  35.04 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.209294  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1017  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  28.77 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.059045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5652  hypothetical protein  24.32 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445869 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2388  hypothetical protein  27.21 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0000543709  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4451  hypothetical protein  34.87 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2515  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  26.99 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.964396  normal  0.161309 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3422  hypothetical protein  32.91 
 
 		 175 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3289  hypothetical protein  26.21 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17193  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2519  hypothetical protein  25 
 
 		 189 aa  47.4  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0448156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6102  hypothetical protein  32.68 
 
 		 259 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3273  hypothetical protein  24.31 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.310623  normal  0.268735 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3269  hypothetical protein  31.58 
 
 		 259 aa  44.3  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.170183  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2247  hypothetical protein  30.92 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1699  protein of unknown function DUF1468  31.08 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00744952  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1626  protein of unknown function DUF1468  31.08 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4010  protein of unknown function DUF1468  26.85 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>