40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6377 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6377  protein of unknown function DUF1468  100 
 
 		 162 aa  311  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0318  protein of unknown function DUF1468  61.73 
 
 		 162 aa  207  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1250  protein of unknown function DUF1468  63.58 
 
 		 162 aa  206  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3238  hypothetical protein  62.96 
 
 		 162 aa  191  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3881  hypothetical protein  61.73 
 
 		 162 aa  190  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2746  protein of unknown function DUF1468  60.49 
 
 		 162 aa  190  7e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5394  hypothetical protein  56.79 
 
 		 162 aa  186  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1069  hypothetical protein  59.88 
 
 		 162 aa  181  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4019  hypothetical protein  52.87 
 
 		 191 aa  180  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3412  hypothetical protein  60.49 
 
 		 162 aa  177  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3213  hypothetical protein  57.41 
 
 		 163 aa  166  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3057  hypothetical protein  44.44 
 
 		 154 aa  124  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.542424 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2305  hypothetical protein  45.68 
 
 		 154 aa  121  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  40.85 
 
 		 164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  38.12 
 
 		 152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1438  protein of unknown function DUF1468  37.89 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.832604 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3643  hypothetical protein  42.07 
 
 		 153 aa  87.4  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.025791  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0794  hypothetical protein  42.86 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0826  hypothetical protein  39.13 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445007 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0845  hypothetical protein  37.89 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  33.76 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4403  hypothetical protein  35.34 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.209294  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4103  hypothetical protein  34.27 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3167  protein of unknown function DUF1468  33.57 
 
 		 153 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3458  protein of unknown function DUF1468  34.27 
 
 		 153 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0197428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0741  protein of unknown function DUF1468  41.51 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48344  normal  0.546388 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0811  protein of unknown function DUF1468  42.77 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4451  hypothetical protein  32.91 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2515  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  27.7 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.964396  normal  0.161309 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3422  hypothetical protein  32.67 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2388  hypothetical protein  28.93 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0000543709  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5652  hypothetical protein  26.09 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2564  protein of unknown function DUF1468  32.91 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2146  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  26.85 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908a  hypothetical protein  28.1 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0414  hypothetical protein  30.57 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3223  hypothetical protein  28.12 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2919  hypothetical protein  30.92 
 
 		 175 aa  48.5  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169398  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1331  hypothetical protein  38.05 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1017  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  25.66 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.059045  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>