40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1017 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1017  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  100 
 
 		 159 aa  315  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.059045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908a  hypothetical protein  58.33 
 
 		 187 aa  187  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2515  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  60.26 
 
 		 160 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.964396  normal  0.161309 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5652  hypothetical protein  55.41 
 
 		 160 aa  177  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445869 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2146  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  53.21 
 
 		 162 aa  168  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1250  protein of unknown function DUF1468  30.67 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5394  hypothetical protein  32.03 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  29.86 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2746  protein of unknown function DUF1468  28.1 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4019  hypothetical protein  26.63 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3881  hypothetical protein  27.92 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  27.08 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3238  hypothetical protein  26.97 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2919  hypothetical protein  30.2 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169398  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2388  hypothetical protein  25.68 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0000543709  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1069  hypothetical protein  30.92 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3223  hypothetical protein  27.81 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0318  protein of unknown function DUF1468  26.67 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3458  protein of unknown function DUF1468  32.14 
 
 		 153 aa  51.6  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0197428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3289  hypothetical protein  32.89 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17193  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4403  hypothetical protein  30.33 
 
 		 154 aa  50.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.209294  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  27.08 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4103  hypothetical protein  27.86 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3412  hypothetical protein  28.1 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2305  hypothetical protein  30.41 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3422  hypothetical protein  34.67 
 
 		 175 aa  48.1  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1438  protein of unknown function DUF1468  30 
 
 		 153 aa  47.8  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.832604 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0414  hypothetical protein  28.57 
 
 		 168 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4451  hypothetical protein  29.05 
 
 		 148 aa  47.8  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3167  protein of unknown function DUF1468  31.43 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6102  hypothetical protein  26.85 
 
 		 259 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0554  hypothetical protein  27.2 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2564  protein of unknown function DUF1468  25.97 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3250  hypothetical protein  29.49 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3273  hypothetical protein  25.52 
 
 		 140 aa  44.7  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.310623  normal  0.268735 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0794  hypothetical protein  40.82 
 
 		 161 aa  44.3  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3213  hypothetical protein  29.8 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1331  hypothetical protein  29.86 
 
 		 153 aa  42.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3358  hypothetical protein  28.77 
 
 		 166 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103855 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3057  hypothetical protein  30.87 
 
 		 154 aa  40.8  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.542424 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>