29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3250 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3250  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  313  7e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3223  hypothetical protein  40 
 
 		 149 aa  89.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2919  hypothetical protein  34.48 
 
 		 175 aa  72  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169398  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  32.45 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4103  hypothetical protein  32 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2388  hypothetical protein  28.67 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0000543709  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4451  hypothetical protein  35.17 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4403  hypothetical protein  35.45 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.209294  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908a  hypothetical protein  29.53 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1250  protein of unknown function DUF1468  29.03 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1017  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  29.49 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.059045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5652  hypothetical protein  28.76 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445869 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2146  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  32 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  28.47 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  30.2 
 
 		 150 aa  51.2  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3167  protein of unknown function DUF1468  32.12 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3643  hypothetical protein  36.75 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.025791  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3881  hypothetical protein  26.28 
 
 		 162 aa  47.8  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0845  hypothetical protein  31.72 
 
 		 153 aa  47.4  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5394  hypothetical protein  25.81 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3458  protein of unknown function DUF1468  30.66 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0197428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3238  hypothetical protein  30.32 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0826  hypothetical protein  31.13 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445007 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7082  hypothetical protein  28.67 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4019  hypothetical protein  28.07 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3057  hypothetical protein  28.57 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.542424 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1438  protein of unknown function DUF1468  26.39 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.832604 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3289  hypothetical protein  29.79 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17193  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0794  hypothetical protein  30.87 
 
 		 161 aa  41.6  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>