34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2388 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2388  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  294  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0000543709  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3223  hypothetical protein  26 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  28.97 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3250  hypothetical protein  32.46 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4403  hypothetical protein  29.69 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.209294  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2146  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  26.71 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  32.5 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4103  hypothetical protein  28.57 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1250  protein of unknown function DUF1468  26.11 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3213  hypothetical protein  27.63 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  27.4 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3881  hypothetical protein  28.29 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1017  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  25.68 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.059045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5394  hypothetical protein  25 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2919  hypothetical protein  25.71 
 
 		 175 aa  53.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169398  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0318  protein of unknown function DUF1468  24.84 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3273  hypothetical protein  29.79 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.310623  normal  0.268735 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1438  protein of unknown function DUF1468  29.59 
 
 		 153 aa  50.1  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.832604 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5652  hypothetical protein  22.37 
 
 		 160 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445869 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2746  protein of unknown function DUF1468  26.71 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3238  hypothetical protein  25.66 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6377  protein of unknown function DUF1468  27.67 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1069  hypothetical protein  25 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908a  hypothetical protein  26.92 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3167  protein of unknown function DUF1468  29.08 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3458  protein of unknown function DUF1468  27.66 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0197428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3643  hypothetical protein  29.53 
 
 		 153 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.025791  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2305  hypothetical protein  30.21 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4019  hypothetical protein  38.18 
 
 		 191 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0826  hypothetical protein  30.61 
 
 		 153 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445007 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2515  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  26.56 
 
 		 160 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.964396  normal  0.161309 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0794  hypothetical protein  29.41 
 
 		 161 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3422  hypothetical protein  26.71 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2564  protein of unknown function DUF1468  23.87 
 
 		 158 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>