46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3422 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3422  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  342  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4103  hypothetical protein  69.74 
 
 
153 aa  209  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3458  protein of unknown function DUF1468  68.42 
 
 
153 aa  188  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0197428  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3167  protein of unknown function DUF1468  67.76 
 
 
153 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139104  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4403  hypothetical protein  67.42 
 
 
154 aa  179  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.209294  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  39.46 
 
 
150 aa  87  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1331  hypothetical protein  43.85 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2746  protein of unknown function DUF1468  33.11 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908a  hypothetical protein  31.46 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1250  protein of unknown function DUF1468  33.11 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3881  hypothetical protein  33.53 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4019  hypothetical protein  31.95 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242542  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3412  hypothetical protein  34.44 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  30.86 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1017  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  34.67 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.059045  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0318  protein of unknown function DUF1468  31.79 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3289  hypothetical protein  42.52 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17193  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3213  hypothetical protein  35.66 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  29.85 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0414  hypothetical protein  35.04 
 
 
168 aa  63.2  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5394  hypothetical protein  30.67 
 
 
162 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2515  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  31.58 
 
 
160 aa  62  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.964396  normal  0.161309 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3238  hypothetical protein  31.74 
 
 
162 aa  61.2  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020333  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1069  hypothetical protein  35.53 
 
 
162 aa  60.8  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6377  protein of unknown function DUF1468  32.67 
 
 
162 aa  60.8  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0554  hypothetical protein  31.62 
 
 
169 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.740481  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3223  hypothetical protein  37.62 
 
 
149 aa  55.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2388  hypothetical protein  26.97 
 
 
150 aa  54.7  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0000543709  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4451  hypothetical protein  33.11 
 
 
148 aa  52.4  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2146  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  29.93 
 
 
162 aa  51.6  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3057  hypothetical protein  35.42 
 
 
154 aa  51.6  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.542424 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2033  tripartite tricarboxylate transporter TctA  31.73 
 
 
166 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3358  hypothetical protein  34.62 
 
 
166 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0103855 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7082  hypothetical protein  26.76 
 
 
153 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1438  protein of unknown function DUF1468  29.1 
 
 
153 aa  46.6  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.832604 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2564  protein of unknown function DUF1468  31.85 
 
 
158 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2919  hypothetical protein  28.57 
 
 
175 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169398  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2305  hypothetical protein  32.87 
 
 
154 aa  45.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3643  hypothetical protein  33.1 
 
 
153 aa  45.1  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.025791  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5652  hypothetical protein  26.81 
 
 
160 aa  44.7  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0445869 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3250  hypothetical protein  33.57 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1626  protein of unknown function DUF1468  36.96 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1699  protein of unknown function DUF1468  36.96 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00744952  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4010  protein of unknown function DUF1468  32.17 
 
 
166 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0845  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  41.6  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2247  hypothetical protein  34.56 
 
 
214 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>