49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2746 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2746  protein of unknown function DUF1468  100 
 
 		 162 aa  311  2.9999999999999996e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3412  hypothetical protein  98.15 
 
 		 162 aa  308  2.9999999999999997e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1250  protein of unknown function DUF1468  72.22 
 
 		 162 aa  238  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0318  protein of unknown function DUF1468  69.14 
 
 		 162 aa  229  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1069  hypothetical protein  78.4 
 
 		 162 aa  227  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5394  hypothetical protein  68.52 
 
 		 162 aa  226  9e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3238  hypothetical protein  71.6 
 
 		 162 aa  224  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3881  hypothetical protein  69.14 
 
 		 162 aa  221  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4019  hypothetical protein  60.92 
 
 		 191 aa  209  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3213  hypothetical protein  63.58 
 
 		 163 aa  192  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6377  protein of unknown function DUF1468  60.49 
 
 		 162 aa  176  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3057  hypothetical protein  49.38 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.542424 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2305  hypothetical protein  46.3 
 
 		 154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  39.51 
 
 		 164 aa  124  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  38.12 
 
 		 152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3643  hypothetical protein  40.74 
 
 		 153 aa  101  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.025791  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0845  hypothetical protein  40 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0826  hypothetical protein  41.88 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445007 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1438  protein of unknown function DUF1468  38.75 
 
 		 153 aa  92  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.832604 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0794  hypothetical protein  38.12 
 
 		 161 aa  89.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  35.03 
 
 		 150 aa  83.6  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0741  protein of unknown function DUF1468  37.97 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48344  normal  0.546388 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4403  hypothetical protein  34.85 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.209294  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0811  protein of unknown function DUF1468  39.24 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2146  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  30.46 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908a  hypothetical protein  30.77 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1017  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  28.1 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.059045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3422  hypothetical protein  33.11 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2515  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  29.33 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.964396  normal  0.161309 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4103  hypothetical protein  33.09 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3167  protein of unknown function DUF1468  34.97 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4451  hypothetical protein  31.65 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6102  hypothetical protein  27.95 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5652  hypothetical protein  28.03 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2564  protein of unknown function DUF1468  32.48 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3458  protein of unknown function DUF1468  32.17 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0197428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3289  hypothetical protein  29.01 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17193  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1331  hypothetical protein  35.14 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7082  hypothetical protein  27.27 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0414  hypothetical protein  29.75 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3223  hypothetical protein  28.75 
 
 		 149 aa  50.8  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3358  hypothetical protein  31.91 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103855 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0554  hypothetical protein  23.46 
 
 		 169 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3269  hypothetical protein  21.92 
 
 		 259 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.170183  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2388  hypothetical protein  26.71 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0000543709  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2033  tripartite tricarboxylate transporter TctA  25.79 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4010  protein of unknown function DUF1468  25.81 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2919  hypothetical protein  26.28 
 
 		 175 aa  42.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169398  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21280  hypothetical protein  32.97 
 
 		 152 aa  41.2  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>