52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3057 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3057  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  294  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.542424 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2305  hypothetical protein  56.49 
 
 		 154 aa  172  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2746  protein of unknown function DUF1468  49.38 
 
 		 162 aa  157  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0318  protein of unknown function DUF1468  50 
 
 		 162 aa  157  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1250  protein of unknown function DUF1468  48.15 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5394  hypothetical protein  48.77 
 
 		 162 aa  150  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3881  hypothetical protein  48.15 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4019  hypothetical protein  43.68 
 
 		 191 aa  144  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  49.35 
 
 		 164 aa  144  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3412  hypothetical protein  50 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3238  hypothetical protein  46.91 
 
 		 162 aa  140  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1069  hypothetical protein  50 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6377  protein of unknown function DUF1468  44.44 
 
 		 162 aa  127  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  42.11 
 
 		 152 aa  120  9e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3213  hypothetical protein  46.5 
 
 		 163 aa  118  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1438  protein of unknown function DUF1468  46.05 
 
 		 153 aa  117  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.832604 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0826  hypothetical protein  50.66 
 
 		 153 aa  117  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445007 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3643  hypothetical protein  50.65 
 
 		 153 aa  113  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.025791  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0845  hypothetical protein  48.68 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0794  hypothetical protein  45.39 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  36.24 
 
 		 150 aa  92  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0741  protein of unknown function DUF1468  44.44 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48344  normal  0.546388 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0811  protein of unknown function DUF1468  43.42 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2564  protein of unknown function DUF1468  34.67 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908a  hypothetical protein  32.47 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7082  hypothetical protein  33.11 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4403  hypothetical protein  37.7 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.209294  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3167  protein of unknown function DUF1468  39.55 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3458  protein of unknown function DUF1468  38.06 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0197428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4103  hypothetical protein  33.82 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4451  hypothetical protein  33.76 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2919  hypothetical protein  31.29 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169398  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3422  hypothetical protein  35.42 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1017  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  33.33 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.059045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2146  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  30.34 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1331  hypothetical protein  33.58 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6102  hypothetical protein  30.72 
 
 		 259 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2388  hypothetical protein  30.3 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0000543709  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0414  hypothetical protein  28 
 
 		 168 aa  50.4  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0554  hypothetical protein  23.97 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3269  hypothetical protein  28.47 
 
 		 259 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.170183  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3358  hypothetical protein  29.41 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103855 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3250  hypothetical protein  28.57 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21280  hypothetical protein  40.91 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24401  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2033  tripartite tricarboxylate transporter TctA  29.76 
 
 		 166 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3223  hypothetical protein  26.8 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2515  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  23.94 
 
 		 160 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.964396  normal  0.161309 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5652  hypothetical protein  26.14 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8067  hypothetical protein  31.82 
 
 		 178 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3197  hypothetical protein  24.84 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00506023  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2791  putative tricarboxylate transport protein TctB  33.62 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1828  hypothetical protein  27.88 
 
 		 204 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.47902 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>