54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3643 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3643  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  293  6e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.025791  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  94.12 
 
 		 164 aa  280  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0845  hypothetical protein  86.18 
 
 		 153 aa  223  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0826  hypothetical protein  86.18 
 
 		 153 aa  218  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445007 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0794  hypothetical protein  70.2 
 
 		 161 aa  171  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  51.66 
 
 		 152 aa  159  9e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0741  protein of unknown function DUF1468  67.79 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48344  normal  0.546388 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0811  protein of unknown function DUF1468  67.11 
 
 		 161 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1250  protein of unknown function DUF1468  42.59 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1438  protein of unknown function DUF1468  45.03 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.832604 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2746  protein of unknown function DUF1468  40.74 
 
 		 162 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5394  hypothetical protein  38.89 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3881  hypothetical protein  43.21 
 
 		 162 aa  127  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3057  hypothetical protein  50.65 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.542424 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4019  hypothetical protein  36.78 
 
 		 191 aa  122  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0318  protein of unknown function DUF1468  40.12 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2305  hypothetical protein  46.75 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3412  hypothetical protein  41.36 
 
 		 162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3238  hypothetical protein  39.51 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1069  hypothetical protein  38.89 
 
 		 162 aa  110  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6377  protein of unknown function DUF1468  42.07 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  37.84 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3213  hypothetical protein  36.42 
 
 		 163 aa  93.2  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4103  hypothetical protein  37.3 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0414  hypothetical protein  34 
 
 		 168 aa  77.4  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2564  protein of unknown function DUF1468  35.33 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3223  hypothetical protein  30.92 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7082  hypothetical protein  34 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1331  hypothetical protein  38.52 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2146  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  31.69 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5652  hypothetical protein  29.53 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445869 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3458  protein of unknown function DUF1468  36.36 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0197428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0554  hypothetical protein  28.95 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4403  hypothetical protein  32.23 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.209294  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3167  protein of unknown function DUF1468  34.85 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2919  hypothetical protein  29.66 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169398  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4451  hypothetical protein  35.57 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908a  hypothetical protein  27.89 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2388  hypothetical protein  29.73 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0000543709  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3289  hypothetical protein  30.34 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17193  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4010  protein of unknown function DUF1468  32.67 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6102  hypothetical protein  27.03 
 
 		 259 aa  60.5  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3250  hypothetical protein  36.44 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1017  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  26.21 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.059045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3422  hypothetical protein  33.1 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2515  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  26.95 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.964396  normal  0.161309 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3269  hypothetical protein  25.58 
 
 		 259 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.170183  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2247  hypothetical protein  26.71 
 
 		 214 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2033  tripartite tricarboxylate transporter TctA  24.49 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1699  protein of unknown function DUF1468  26.21 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00744952  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1626  protein of unknown function DUF1468  26.21 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3358  hypothetical protein  20.93 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103855 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3273  hypothetical protein  23.78 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.310623  normal  0.268735 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3197  hypothetical protein  24.39 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00506023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>