46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3238 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3238  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  313  5e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3881  hypothetical protein  80.25 
 
 		 162 aa  254  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2746  protein of unknown function DUF1468  71.6 
 
 		 162 aa  224  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0318  protein of unknown function DUF1468  69.75 
 
 		 162 aa  221  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1250  protein of unknown function DUF1468  67.9 
 
 		 162 aa  216  7.999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1069  hypothetical protein  75.31 
 
 		 162 aa  216  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3412  hypothetical protein  72.22 
 
 		 162 aa  209  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5394  hypothetical protein  64.81 
 
 		 162 aa  202  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4019  hypothetical protein  59.77 
 
 		 191 aa  196  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3213  hypothetical protein  61.11 
 
 		 163 aa  183  7e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6377  protein of unknown function DUF1468  62.96 
 
 		 162 aa  176  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2305  hypothetical protein  47.53 
 
 		 154 aa  127  9.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3057  hypothetical protein  46.91 
 
 		 154 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.542424 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  40.99 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  38.27 
 
 		 164 aa  107  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1438  protein of unknown function DUF1468  37.89 
 
 		 153 aa  91.3  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.832604 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3643  hypothetical protein  39.51 
 
 		 153 aa  88.2  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.025791  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0826  hypothetical protein  39.13 
 
 		 153 aa  84  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445007 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0794  hypothetical protein  40 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0845  hypothetical protein  38.51 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0741  protein of unknown function DUF1468  39.24 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48344  normal  0.546388 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0811  protein of unknown function DUF1468  40.51 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2146  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  31.01 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2515  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  31.37 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.964396  normal  0.161309 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5652  hypothetical protein  27.5 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445869 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1017  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  26.97 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.059045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  28.66 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4403  hypothetical protein  32.58 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.209294  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0414  hypothetical protein  32.19 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908a  hypothetical protein  30.32 
 
 		 187 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2564  protein of unknown function DUF1468  30.38 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6102  hypothetical protein  27.39 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3167  protein of unknown function DUF1468  34.97 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4451  hypothetical protein  31.65 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1331  hypothetical protein  35.71 
 
 		 153 aa  51.2  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4103  hypothetical protein  33.03 
 
 		 153 aa  51.2  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3422  hypothetical protein  32.93 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3458  protein of unknown function DUF1468  32.87 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0197428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2919  hypothetical protein  29.03 
 
 		 175 aa  47.4  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169398  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2388  hypothetical protein  25.66 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0000543709  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3289  hypothetical protein  26.62 
 
 		 151 aa  45.1  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17193  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7082  hypothetical protein  24.36 
 
 		 153 aa  44.3  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3269  hypothetical protein  24.31 
 
 		 259 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.170183  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2033  tripartite tricarboxylate transporter TctA  26.28 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3223  hypothetical protein  28.12 
 
 		 149 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21280  hypothetical protein  34.94 
 
 		 152 aa  40.8  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>