34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2919 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2919  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  335  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169398  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3223  hypothetical protein  34.9 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3250  hypothetical protein  34.48 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  28.28 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  30.82 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2146  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  29.88 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5652  hypothetical protein  29.8 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445869 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908a  hypothetical protein  29.53 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1017  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  30.2 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.059045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2388  hypothetical protein  25.71 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0000543709  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2515  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  32.7 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.964396  normal  0.161309 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1438  protein of unknown function DUF1468  26.21 
 
 		 153 aa  52  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.832604 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3057  hypothetical protein  31.29 
 
 		 154 aa  51.2  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.542424 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4103  hypothetical protein  28.79 
 
 		 153 aa  50.8  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4451  hypothetical protein  29.73 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2564  protein of unknown function DUF1468  31.72 
 
 		 158 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5394  hypothetical protein  29.68 
 
 		 162 aa  48.5  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4403  hypothetical protein  30.7 
 
 		 154 aa  48.1  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.209294  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3238  hypothetical protein  29.03 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0826  hypothetical protein  30.34 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445007 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2305  hypothetical protein  32.65 
 
 		 154 aa  45.4  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1069  hypothetical protein  27.1 
 
 		 162 aa  44.7  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3289  hypothetical protein  32.19 
 
 		 151 aa  44.3  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17193  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1250  protein of unknown function DUF1468  27.27 
 
 		 162 aa  44.3  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3643  hypothetical protein  29.66 
 
 		 153 aa  44.3  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.025791  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3881  hypothetical protein  25.81 
 
 		 162 aa  44.3  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4019  hypothetical protein  23.6 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  34.91 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0318  protein of unknown function DUF1468  25.97 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0554  hypothetical protein  28.17 
 
 		 169 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2746  protein of unknown function DUF1468  26.28 
 
 		 162 aa  42.4  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0794  hypothetical protein  31.47 
 
 		 161 aa  41.6  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3458  protein of unknown function DUF1468  27.48 
 
 		 153 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0197428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3213  hypothetical protein  29.87 
 
 		 163 aa  40.8  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>