49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3881 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3881  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  312  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3238  hypothetical protein  80.25 
 
 		 162 aa  254  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2746  protein of unknown function DUF1468  69.14 
 
 		 162 aa  221  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1250  protein of unknown function DUF1468  67.28 
 
 		 162 aa  214  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0318  protein of unknown function DUF1468  66.05 
 
 		 162 aa  210  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4019  hypothetical protein  60.34 
 
 		 191 aa  206  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1069  hypothetical protein  70.99 
 
 		 162 aa  202  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3412  hypothetical protein  68.52 
 
 		 162 aa  202  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5394  hypothetical protein  61.11 
 
 		 162 aa  201  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3213  hypothetical protein  62.96 
 
 		 163 aa  193  8.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6377  protein of unknown function DUF1468  61.73 
 
 		 162 aa  177  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3057  hypothetical protein  48.15 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.542424 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2305  hypothetical protein  45.06 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  41.36 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  37.27 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3643  hypothetical protein  43.21 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.025791  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0845  hypothetical protein  40.62 
 
 		 153 aa  91.3  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0826  hypothetical protein  41.88 
 
 		 153 aa  90.9  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445007 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1438  protein of unknown function DUF1468  38.51 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.832604 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0794  hypothetical protein  40.99 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0811  protein of unknown function DUF1468  40.74 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0741  protein of unknown function DUF1468  39.62 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48344  normal  0.546388 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  30.77 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4403  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.209294  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2515  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  28.76 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.964396  normal  0.161309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6102  hypothetical protein  28.66 
 
 		 259 aa  60.5  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1017  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  27.92 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.059045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3422  hypothetical protein  33.53 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5652  hypothetical protein  28.3 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445869 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0414  hypothetical protein  29.27 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908a  hypothetical protein  30.38 
 
 		 187 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2146  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  26.62 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3167  protein of unknown function DUF1468  35.66 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3458  protein of unknown function DUF1468  41.84 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0197428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2388  hypothetical protein  28.29 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0000543709  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4451  hypothetical protein  32.28 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2564  protein of unknown function DUF1468  31.01 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4103  hypothetical protein  31.9 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7082  hypothetical protein  28.21 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1331  hypothetical protein  40.18 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1318  hypothetical protein  28.21 
 
 		 221 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.417426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1514  hypothetical protein  28.21 
 
 		 221 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2919  hypothetical protein  25.81 
 
 		 175 aa  44.3  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169398  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21280  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24401  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3269  hypothetical protein  22.92 
 
 		 259 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.170183  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2033  tripartite tricarboxylate transporter TctA  27.56 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3289  hypothetical protein  25.32 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17193  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3223  hypothetical protein  25.62 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3197  hypothetical protein  30.4 
 
 		 170 aa  40.4  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00506023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>