44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2305 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2305  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  295  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3057  hypothetical protein  56.49 
 
 		 154 aa  167  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.542424 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2746  protein of unknown function DUF1468  46.3 
 
 		 162 aa  147  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1250  protein of unknown function DUF1468  46.91 
 
 		 162 aa  141  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0318  protein of unknown function DUF1468  43.83 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1069  hypothetical protein  50.62 
 
 		 162 aa  140  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3238  hypothetical protein  47.53 
 
 		 162 aa  140  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5394  hypothetical protein  45.68 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3412  hypothetical protein  46.91 
 
 		 162 aa  136  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3881  hypothetical protein  45.06 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4019  hypothetical protein  39.66 
 
 		 191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  45.45 
 
 		 164 aa  130  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3213  hypothetical protein  46.3 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  41.45 
 
 		 152 aa  115  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6377  protein of unknown function DUF1468  45.68 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1438  protein of unknown function DUF1468  42.11 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.832604 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3643  hypothetical protein  46.75 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.025791  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0826  hypothetical protein  47.06 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445007 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0845  hypothetical protein  45.75 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0794  hypothetical protein  44.74 
 
 		 161 aa  95.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  35.81 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0741  protein of unknown function DUF1468  44.08 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48344  normal  0.546388 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0811  protein of unknown function DUF1468  44 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7082  hypothetical protein  34.17 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1331  hypothetical protein  36.5 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3458  protein of unknown function DUF1468  35.34 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0197428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2919  hypothetical protein  32.65 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169398  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2564  protein of unknown function DUF1468  32.67 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1017  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  30.41 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.059045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3167  protein of unknown function DUF1468  34.59 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908a  hypothetical protein  30.67 
 
 		 187 aa  51.2  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2146  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  27.78 
 
 		 162 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5652  hypothetical protein  26 
 
 		 160 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445869 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4451  hypothetical protein  32.67 
 
 		 148 aa  47.4  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0554  hypothetical protein  31.82 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4403  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.209294  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3273  hypothetical protein  26.03 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.310623  normal  0.268735 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2515  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  28.47 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.964396  normal  0.161309 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3197  hypothetical protein  26.09 
 
 		 170 aa  44.3  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00506023  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2388  hypothetical protein  29.7 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0000543709  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4010  protein of unknown function DUF1468  33.33 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4103  hypothetical protein  28.57 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1828  hypothetical protein  32.95 
 
 		 204 aa  42.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.47902 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3223  hypothetical protein  26.97 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>