39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4010 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4010  protein of unknown function DUF1468  100 
 
 		 166 aa  317  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2033  tripartite tricarboxylate transporter TctA  67.47 
 
 		 166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3358  hypothetical protein  65.06 
 
 		 166 aa  184  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6102  hypothetical protein  62.16 
 
 		 259 aa  181  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3269  hypothetical protein  63.43 
 
 		 259 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.170183  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0554  hypothetical protein  36.62 
 
 		 169 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1699  protein of unknown function DUF1468  36.43 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00744952  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1626  protein of unknown function DUF1468  36.43 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1318  hypothetical protein  36.71 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.417426 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2247  hypothetical protein  35.92 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1514  hypothetical protein  36.71 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  31.33 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5394  hypothetical protein  30 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7082  hypothetical protein  31.47 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  28.19 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4019  hypothetical protein  30.81 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2746  protein of unknown function DUF1468  27.04 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1250  protein of unknown function DUF1468  26.42 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3238  hypothetical protein  28.3 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  32.77 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3881  hypothetical protein  25.79 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2564  protein of unknown function DUF1468  38.89 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1331  hypothetical protein  36.7 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3643  hypothetical protein  32.67 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.025791  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3412  hypothetical protein  28.3 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3223  hypothetical protein  28.77 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0845  hypothetical protein  30.46 
 
 		 153 aa  52  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1438  protein of unknown function DUF1468  29.14 
 
 		 153 aa  50.8  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.832604 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0318  protein of unknown function DUF1468  27.95 
 
 		 162 aa  50.8  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4103  hypothetical protein  33.59 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3458  protein of unknown function DUF1468  36.22 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0197428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3167  protein of unknown function DUF1468  36.09 
 
 		 153 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4403  hypothetical protein  33.88 
 
 		 154 aa  47.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.209294  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1069  hypothetical protein  30 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3213  hypothetical protein  30.77 
 
 		 163 aa  44.3  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0826  hypothetical protein  28.48 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445007 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0794  hypothetical protein  32.9 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2515  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  28.92 
 
 		 160 aa  42  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.964396  normal  0.161309 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2305  hypothetical protein  31.13 
 
 		 154 aa  41.2  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>