44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0318 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0318  protein of unknown function DUF1468  100 
 
 		 162 aa  315  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1250  protein of unknown function DUF1468  75.93 
 
 		 162 aa  251  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2746  protein of unknown function DUF1468  69.14 
 
 		 162 aa  229  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3238  hypothetical protein  69.75 
 
 		 162 aa  221  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5394  hypothetical protein  64.2 
 
 		 162 aa  214  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1069  hypothetical protein  70.99 
 
 		 162 aa  213  7e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3412  hypothetical protein  69.14 
 
 		 162 aa  211  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3881  hypothetical protein  66.05 
 
 		 162 aa  210  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4019  hypothetical protein  59.77 
 
 		 191 aa  207  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6377  protein of unknown function DUF1468  61.73 
 
 		 162 aa  192  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3213  hypothetical protein  59.26 
 
 		 163 aa  186  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3057  hypothetical protein  50 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.542424 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2305  hypothetical protein  43.83 
 
 		 154 aa  131  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  39.51 
 
 		 164 aa  120  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  35.4 
 
 		 152 aa  100  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0826  hypothetical protein  40.37 
 
 		 153 aa  88.2  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445007 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3643  hypothetical protein  40.12 
 
 		 153 aa  87.4  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.025791  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0794  hypothetical protein  38.12 
 
 		 161 aa  85.5  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0845  hypothetical protein  39.75 
 
 		 153 aa  84.7  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1438  protein of unknown function DUF1468  32.92 
 
 		 153 aa  84.3  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.832604 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  30.57 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0741  protein of unknown function DUF1468  39.38 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48344  normal  0.546388 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0811  protein of unknown function DUF1468  37.97 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4403  hypothetical protein  32.33 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.209294  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3167  protein of unknown function DUF1468  34.72 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3458  protein of unknown function DUF1468  34.03 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0197428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2146  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  29.05 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2515  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  30.82 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.964396  normal  0.161309 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5652  hypothetical protein  28.95 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445869 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908a  hypothetical protein  29.41 
 
 		 187 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3422  hypothetical protein  31.79 
 
 		 175 aa  53.9  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4103  hypothetical protein  31.25 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3289  hypothetical protein  27.92 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17193  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1017  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  26.67 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.059045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2388  hypothetical protein  24.84 
 
 		 150 aa  51.6  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0000543709  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2564  protein of unknown function DUF1468  28.4 
 
 		 158 aa  51.2  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4451  hypothetical protein  29.75 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21280  hypothetical protein  41.76 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24401  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6102  hypothetical protein  27.95 
 
 		 259 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3269  hypothetical protein  26.53 
 
 		 259 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.170183  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0414  hypothetical protein  30.22 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3197  hypothetical protein  36.67 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00506023  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2919  hypothetical protein  25.97 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169398  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3223  hypothetical protein  25 
 
 		 149 aa  41.2  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>