46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4019 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4019  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1069  hypothetical protein  67.82 
 
 		 162 aa  216  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1250  protein of unknown function DUF1468  64.94 
 
 		 162 aa  214  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2746  protein of unknown function DUF1468  60.92 
 
 		 162 aa  209  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5394  hypothetical protein  61.49 
 
 		 162 aa  209  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0318  protein of unknown function DUF1468  59.77 
 
 		 162 aa  207  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3881  hypothetical protein  60.34 
 
 		 162 aa  206  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3238  hypothetical protein  59.77 
 
 		 162 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3412  hypothetical protein  62.64 
 
 		 162 aa  193  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3213  hypothetical protein  54.6 
 
 		 163 aa  179  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6377  protein of unknown function DUF1468  52.87 
 
 		 162 aa  164  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3057  hypothetical protein  43.68 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.542424 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2305  hypothetical protein  39.66 
 
 		 154 aa  123  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  35.33 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  38.37 
 
 		 152 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1438  protein of unknown function DUF1468  37.79 
 
 		 153 aa  97.1  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.832604 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3643  hypothetical protein  36.78 
 
 		 153 aa  89.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.025791  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0845  hypothetical protein  34.68 
 
 		 153 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0826  hypothetical protein  34.1 
 
 		 153 aa  85.5  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445007 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0794  hypothetical protein  32.56 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  32.74 
 
 		 150 aa  74.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5652  hypothetical protein  29.59 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445869 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2146  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  28.22 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908a  hypothetical protein  29.76 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2515  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  27.17 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.964396  normal  0.161309 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0811  protein of unknown function DUF1468  34.71 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1017  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  26.63 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.059045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3167  protein of unknown function DUF1468  32.92 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3458  protein of unknown function DUF1468  32.3 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0197428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2564  protein of unknown function DUF1468  31.76 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4403  hypothetical protein  30.12 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.209294  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4103  hypothetical protein  29.81 
 
 		 153 aa  57.4  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3422  hypothetical protein  33.13 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21280  hypothetical protein  43.01 
 
 		 152 aa  52.8  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24401  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4451  hypothetical protein  30.41 
 
 		 148 aa  52.4  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0741  protein of unknown function DUF1468  51.22 
 
 		 152 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48344  normal  0.546388 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3289  hypothetical protein  28.16 
 
 		 151 aa  49.3  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17193  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0414  hypothetical protein  27.56 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1331  hypothetical protein  31.87 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6102  hypothetical protein  25.43 
 
 		 259 aa  45.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3358  hypothetical protein  29.24 
 
 		 166 aa  44.7  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103855 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3273  hypothetical protein  35 
 
 		 140 aa  44.3  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.310623  normal  0.268735 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2919  hypothetical protein  23.6 
 
 		 175 aa  42.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169398  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2388  hypothetical protein  38.18 
 
 		 150 aa  41.6  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0000543709  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7082  hypothetical protein  22.89 
 
 		 153 aa  41.2  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4010  protein of unknown function DUF1468  28.07 
 
 		 166 aa  41.2  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>