55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0845 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0845  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  294  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  84.21 
 
 		 164 aa  258  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0826  hypothetical protein  89.54 
 
 		 153 aa  231  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445007 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3643  hypothetical protein  86.18 
 
 		 153 aa  221  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.025791  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0794  hypothetical protein  67.11 
 
 		 161 aa  166  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  49.67 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0741  protein of unknown function DUF1468  65.56 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48344  normal  0.546388 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0811  protein of unknown function DUF1468  65.56 
 
 		 161 aa  141  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1438  protein of unknown function DUF1468  47.06 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.832604 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1250  protein of unknown function DUF1468  38.51 
 
 		 162 aa  124  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3057  hypothetical protein  48.37 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.542424 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2746  protein of unknown function DUF1468  40 
 
 		 162 aa  124  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2305  hypothetical protein  45.75 
 
 		 154 aa  120  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5394  hypothetical protein  36.65 
 
 		 162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4019  hypothetical protein  34.68 
 
 		 191 aa  115  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0318  protein of unknown function DUF1468  39.13 
 
 		 162 aa  114  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3881  hypothetical protein  40.62 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3412  hypothetical protein  40 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1069  hypothetical protein  37.89 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3238  hypothetical protein  38.51 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  36.73 
 
 		 150 aa  97.1  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3213  hypothetical protein  37.34 
 
 		 163 aa  90.5  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6377  protein of unknown function DUF1468  38.12 
 
 		 162 aa  90.1  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4103  hypothetical protein  38.1 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7082  hypothetical protein  34.48 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0414  hypothetical protein  32.67 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2564  protein of unknown function DUF1468  32.03 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3223  hypothetical protein  30.26 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0554  hypothetical protein  28.97 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1331  hypothetical protein  37.78 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3458  protein of unknown function DUF1468  36.36 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0197428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4403  hypothetical protein  31.4 
 
 		 154 aa  67  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.209294  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3167  protein of unknown function DUF1468  35.61 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5652  hypothetical protein  28.19 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445869 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2146  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  29.17 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2919  hypothetical protein  27.59 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169398  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1017  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  27.21 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.059045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3289  hypothetical protein  28.97 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17193  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3250  hypothetical protein  31.72 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4010  protein of unknown function DUF1468  30.46 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2388  hypothetical protein  29.33 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0000543709  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6102  hypothetical protein  25.17 
 
 		 259 aa  54.3  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4451  hypothetical protein  31.54 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908a  hypothetical protein  23.65 
 
 		 187 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3422  hypothetical protein  33.1 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2033  tripartite tricarboxylate transporter TctA  25.88 
 
 		 166 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1318  hypothetical protein  25 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.417426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1514  hypothetical protein  25 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3269  hypothetical protein  24.81 
 
 		 259 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.170183  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2515  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  23.4 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.964396  normal  0.161309 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3358  hypothetical protein  22.35 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103855 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2247  hypothetical protein  25.34 
 
 		 214 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1626  protein of unknown function DUF1468  24.83 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1699  protein of unknown function DUF1468  24.83 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00744952  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3197  hypothetical protein  23.02 
 
 		 170 aa  40.4  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00506023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>