29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2247 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2247  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1626  protein of unknown function DUF1468  96.39 
 
 
166 aa  265  4e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1699  protein of unknown function DUF1468  95.78 
 
 
166 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00744952  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0554  hypothetical protein  63.58 
 
 
169 aa  193  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.740481  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1318  hypothetical protein  41.45 
 
 
221 aa  98.2  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.417426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1514  hypothetical protein  41.45 
 
 
221 aa  98.2  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6102  hypothetical protein  38.89 
 
 
259 aa  89.4  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3358  hypothetical protein  38.46 
 
 
166 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0103855 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2033  tripartite tricarboxylate transporter TctA  38.03 
 
 
166 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3269  hypothetical protein  31.11 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.170183  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4010  protein of unknown function DUF1468  36.43 
 
 
166 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3289  hypothetical protein  41.43 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17193  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  34.72 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3223  hypothetical protein  30.56 
 
 
149 aa  62  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4403  hypothetical protein  37.82 
 
 
154 aa  57.4  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.209294  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7082  hypothetical protein  33.81 
 
 
153 aa  56.6  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  26.03 
 
 
164 aa  55.8  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3167  protein of unknown function DUF1468  35.07 
 
 
153 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139104  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5394  hypothetical protein  25.32 
 
 
162 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908a  hypothetical protein  30.29 
 
 
187 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5652  hypothetical protein  26.67 
 
 
160 aa  45.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0445869 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3458  protein of unknown function DUF1468  31.06 
 
 
153 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0197428  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0794  hypothetical protein  33.55 
 
 
161 aa  45.1  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4103  hypothetical protein  34.29 
 
 
153 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3643  hypothetical protein  26.71 
 
 
153 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.025791  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3422  hypothetical protein  34.31 
 
 
175 aa  42.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1250  protein of unknown function DUF1468  24.03 
 
 
162 aa  42.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4019  hypothetical protein  24.26 
 
 
191 aa  42.4  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242542  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2564  protein of unknown function DUF1468  38.03 
 
 
158 aa  41.6  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>