48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1438 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1438  protein of unknown function DUF1468  100 
 
 		 153 aa  298  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.832604 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  71.71 
 
 		 152 aa  226  7e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  44.37 
 
 		 164 aa  140  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0826  hypothetical protein  51.66 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445007 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0794  hypothetical protein  46.98 
 
 		 161 aa  117  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3643  hypothetical protein  45.03 
 
 		 153 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.025791  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0845  hypothetical protein  47.68 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3057  hypothetical protein  46.05 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.542424 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5394  hypothetical protein  38.12 
 
 		 162 aa  107  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4019  hypothetical protein  37.79 
 
 		 191 aa  107  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2746  protein of unknown function DUF1468  38.75 
 
 		 162 aa  104  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3238  hypothetical protein  37.89 
 
 		 162 aa  103  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2305  hypothetical protein  42.11 
 
 		 154 aa  103  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0741  protein of unknown function DUF1468  48.99 
 
 		 152 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48344  normal  0.546388 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3881  hypothetical protein  38.51 
 
 		 162 aa  100  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0811  protein of unknown function DUF1468  49.66 
 
 		 161 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1250  protein of unknown function DUF1468  36.25 
 
 		 162 aa  99  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1069  hypothetical protein  39.75 
 
 		 162 aa  93.6  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0318  protein of unknown function DUF1468  32.92 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3412  hypothetical protein  39.38 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6377  protein of unknown function DUF1468  38.12 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3213  hypothetical protein  36.71 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1331  hypothetical protein  41.48 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2564  protein of unknown function DUF1468  29.56 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7082  hypothetical protein  33.56 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2919  hypothetical protein  26.21 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169398  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3223  hypothetical protein  27.89 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1017  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  30 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.059045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4403  hypothetical protein  31.47 
 
 		 154 aa  57  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.209294  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2388  hypothetical protein  28.81 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0000543709  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3458  protein of unknown function DUF1468  32.84 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0197428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3167  protein of unknown function DUF1468  35.07 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2146  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  31.25 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908a  hypothetical protein  29.68 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2515  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  29.37 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.964396  normal  0.161309 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4103  hypothetical protein  32.09 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6102  hypothetical protein  28.1 
 
 		 259 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3250  hypothetical protein  26.39 
 
 		 165 aa  48.5  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21280  hypothetical protein  32.21 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24401  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5652  hypothetical protein  27.39 
 
 		 160 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445869 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3197  hypothetical protein  26.72 
 
 		 170 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00506023  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0414  hypothetical protein  29.8 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4451  hypothetical protein  32.21 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0554  hypothetical protein  25 
 
 		 169 aa  43.9  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3273  hypothetical protein  25.17 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.310623  normal  0.268735 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4010  protein of unknown function DUF1468  29.14 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3269  hypothetical protein  27.42 
 
 		 259 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.170183  normal  0.426633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>