40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4451 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4451  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  285  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3223  hypothetical protein  35.57 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  33.56 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2746  protein of unknown function DUF1468  31.65 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4019  hypothetical protein  30.41 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3881  hypothetical protein  32.28 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5394  hypothetical protein  30.38 
 
 		 162 aa  67  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3238  hypothetical protein  31.65 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0318  protein of unknown function DUF1468  29.75 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  31.13 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1250  protein of unknown function DUF1468  29.11 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908a  hypothetical protein  30 
 
 		 187 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6377  protein of unknown function DUF1468  30.38 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1017  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  29.05 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.059045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3412  hypothetical protein  32.28 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3250  hypothetical protein  35.17 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3057  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.542424 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  31.43 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1438  protein of unknown function DUF1468  32.21 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.832604 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4403  hypothetical protein  35.83 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.209294  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2919  hypothetical protein  29.73 
 
 		 175 aa  57  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169398  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2305  hypothetical protein  32.67 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5652  hypothetical protein  28.29 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445869 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2388  hypothetical protein  29.29 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0000543709  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2564  protein of unknown function DUF1468  37.01 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2146  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  28.28 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3213  hypothetical protein  34.57 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1069  hypothetical protein  32.91 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3643  hypothetical protein  35.57 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.025791  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4103  hypothetical protein  28.77 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3422  hypothetical protein  33.11 
 
 		 175 aa  51.2  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0794  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3289  hypothetical protein  29.37 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17193  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2515  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  27.4 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.964396  normal  0.161309 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7082  hypothetical protein  29.66 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3167  protein of unknown function DUF1468  30.34 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3458  protein of unknown function DUF1468  30.34 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0197428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0826  hypothetical protein  32.21 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445007 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0845  hypothetical protein  31.54 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3269  hypothetical protein  29.85 
 
 		 259 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.170183  normal  0.426633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>