53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3963 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  316  7e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3643  hypothetical protein  94.12 
 
 		 153 aa  233  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.025791  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0826  hypothetical protein  84.87 
 
 		 153 aa  221  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445007 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0845  hypothetical protein  84.21 
 
 		 153 aa  219  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0794  hypothetical protein  68.87 
 
 		 161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  50.33 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0741  protein of unknown function DUF1468  66.44 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48344  normal  0.546388 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0811  protein of unknown function DUF1468  66.44 
 
 		 161 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1438  protein of unknown function DUF1468  44.37 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.832604 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1250  protein of unknown function DUF1468  39.51 
 
 		 162 aa  127  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5394  hypothetical protein  38.89 
 
 		 162 aa  127  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2746  protein of unknown function DUF1468  39.51 
 
 		 162 aa  124  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3057  hypothetical protein  49.35 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.542424 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2305  hypothetical protein  45.45 
 
 		 154 aa  121  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4019  hypothetical protein  35.33 
 
 		 191 aa  120  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0318  protein of unknown function DUF1468  39.51 
 
 		 162 aa  120  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3881  hypothetical protein  41.36 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3412  hypothetical protein  40.12 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1069  hypothetical protein  38.27 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3238  hypothetical protein  38.27 
 
 		 162 aa  107  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  38.93 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6377  protein of unknown function DUF1468  40.85 
 
 		 162 aa  99  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3213  hypothetical protein  34.57 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2564  protein of unknown function DUF1468  36.13 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0414  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3223  hypothetical protein  30.92 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4103  hypothetical protein  35.2 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5652  hypothetical protein  30.2 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445869 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7082  hypothetical protein  32.68 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2146  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  31.69 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1331  hypothetical protein  38.52 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3458  protein of unknown function DUF1468  34.85 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0197428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908a  hypothetical protein  30.61 
 
 		 187 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0554  hypothetical protein  27.63 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3167  protein of unknown function DUF1468  34.09 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3289  hypothetical protein  30.34 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17193  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4403  hypothetical protein  29.75 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.209294  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2919  hypothetical protein  30.82 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169398  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4451  hypothetical protein  33.56 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1017  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  27.08 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.059045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4010  protein of unknown function DUF1468  31.33 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2515  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  28.95 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.964396  normal  0.161309 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2388  hypothetical protein  27.4 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0000543709  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3250  hypothetical protein  32.45 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6102  hypothetical protein  26.17 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3422  hypothetical protein  30.86 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3269  hypothetical protein  26.81 
 
 		 259 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.170183  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2247  hypothetical protein  26.03 
 
 		 214 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3358  hypothetical protein  22.09 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103855 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1699  protein of unknown function DUF1468  24.14 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00744952  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1626  protein of unknown function DUF1468  24.14 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2033  tripartite tricarboxylate transporter TctA  22.89 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3273  hypothetical protein  23.08 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.310623  normal  0.268735 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>