53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1720 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  299  8.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1438  protein of unknown function DUF1468  71.71 
 
 		 153 aa  207  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.832604 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  50.33 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0826  hypothetical protein  52.32 
 
 		 153 aa  137  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445007 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0845  hypothetical protein  49.67 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3643  hypothetical protein  51.66 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.025791  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0794  hypothetical protein  44.97 
 
 		 161 aa  120  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1250  protein of unknown function DUF1468  40 
 
 		 162 aa  113  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3238  hypothetical protein  40.99 
 
 		 162 aa  112  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4019  hypothetical protein  38.37 
 
 		 191 aa  112  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2746  protein of unknown function DUF1468  38.12 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0741  protein of unknown function DUF1468  45.64 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48344  normal  0.546388 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3881  hypothetical protein  37.27 
 
 		 162 aa  104  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2305  hypothetical protein  41.45 
 
 		 154 aa  104  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5394  hypothetical protein  37.5 
 
 		 162 aa  104  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0811  protein of unknown function DUF1468  46.98 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3057  hypothetical protein  42.11 
 
 		 154 aa  104  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.542424 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0318  protein of unknown function DUF1468  35.4 
 
 		 162 aa  100  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3412  hypothetical protein  38.75 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1069  hypothetical protein  39.75 
 
 		 162 aa  96.7  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6377  protein of unknown function DUF1468  38.12 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3213  hypothetical protein  36.31 
 
 		 163 aa  90.9  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1331  hypothetical protein  37.78 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2564  protein of unknown function DUF1468  29.38 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2146  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  31.03 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2919  hypothetical protein  28.28 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169398  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4103  hypothetical protein  32.84 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  30.07 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908a  hypothetical protein  29.53 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3458  protein of unknown function DUF1468  33.58 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0197428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1017  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  29.86 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.059045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2388  hypothetical protein  32.5 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0000543709  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3167  protein of unknown function DUF1468  32.09 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4403  hypothetical protein  28.23 
 
 		 154 aa  57  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.209294  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3223  hypothetical protein  25.68 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2515  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  26.21 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.964396  normal  0.161309 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7082  hypothetical protein  26.71 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0554  hypothetical protein  27.03 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5652  hypothetical protein  27.15 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445869 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3250  hypothetical protein  28.47 
 
 		 165 aa  51.6  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0832  integral membrane protein  31.75 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000357641  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4451  hypothetical protein  28.76 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21280  hypothetical protein  32.41 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24401  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3289  hypothetical protein  28.28 
 
 		 151 aa  47.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17193  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3422  hypothetical protein  29.85 
 
 		 175 aa  47.8  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0414  hypothetical protein  28.67 
 
 		 168 aa  47.4  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6102  hypothetical protein  24.32 
 
 		 259 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3273  hypothetical protein  25.87 
 
 		 140 aa  43.9  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.310623  normal  0.268735 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4010  protein of unknown function DUF1468  28.19 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1514  hypothetical protein  26.42 
 
 		 221 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1318  hypothetical protein  26.42 
 
 		 221 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.417426 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3197  hypothetical protein  22.76 
 
 		 170 aa  40.8  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00506023  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1219  hypothetical protein  28.38 
 
 		 161 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0261954  normal  0.740843 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>