17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1219 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1219  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  311  2.9999999999999996e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0261954  normal  0.740843 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2228  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4492  hypothetical protein  32.09 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2796  hypothetical protein  28.19 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.825323  normal  0.0868424 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3099  hypothetical protein  28 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0825077  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2074  hypothetical protein  28.38 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0483  hypothetical protein  28.57 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3050  small permease component of tripartite tricarboxylate transporter  31.15 
 
 		 196 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0820746  normal  0.460517 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3429  hypothetical protein  31.2 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0516258 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1852  hypothetical protein  31.03 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.946732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2025  hypothetical protein  31.71 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0928756  normal  0.256497 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5628  small permease component of tripartite tricarboxylate transporter (TctB)  28.69 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4225  hypothetical protein  26.39 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.360299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3082  hypothetical protein  29.71 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.583252  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36150  hypothetical protein  29.71 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000272635 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0092  hypothetical protein  29.01 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  28.38 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>