41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2146 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2146  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  100 
 
 		 162 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1017  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  53.21 
 
 		 159 aa  168  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.059045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908a  hypothetical protein  50 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5652  hypothetical protein  51.57 
 
 		 160 aa  161  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445869 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2515  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  52.74 
 
 		 160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.964396  normal  0.161309 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5394  hypothetical protein  31.79 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1250  protein of unknown function DUF1468  32.43 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4019  hypothetical protein  28.22 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  32.88 
 
 		 150 aa  70.5  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2746  protein of unknown function DUF1468  30.46 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  31.69 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  31.03 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1069  hypothetical protein  33.77 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3238  hypothetical protein  31.01 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0414  hypothetical protein  32.72 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2919  hypothetical protein  29.88 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169398  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2388  hypothetical protein  26.71 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0000543709  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3412  hypothetical protein  29.8 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0318  protein of unknown function DUF1468  29.05 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3881  hypothetical protein  26.62 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3289  hypothetical protein  32.65 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17193  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3223  hypothetical protein  29.8 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3213  hypothetical protein  32.45 
 
 		 163 aa  50.8  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6102  hypothetical protein  29.58 
 
 		 259 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6019  hypothetical protein  30.3 
 
 		 128 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214808  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4103  hypothetical protein  27.33 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3643  hypothetical protein  29.17 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.025791  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3273  hypothetical protein  25.69 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.310623  normal  0.268735 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0826  hypothetical protein  30.34 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445007 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2564  protein of unknown function DUF1468  29.93 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1438  protein of unknown function DUF1468  31.25 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.832604 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4451  hypothetical protein  28.28 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4403  hypothetical protein  31.03 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.209294  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0794  hypothetical protein  34.23 
 
 		 161 aa  43.9  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2305  hypothetical protein  27.78 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7082  hypothetical protein  26.39 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0554  hypothetical protein  27.97 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3057  hypothetical protein  30.34 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.542424 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6377  protein of unknown function DUF1468  26.85 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3167  protein of unknown function DUF1468  28.19 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3703  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  40.4  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>