31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3703 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3703  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  302  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0067  integral membrane protein  53.85 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3247  integral membrane protein  44.72 
 
 		 168 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3236  integral membrane protein  44.1 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3298  integral membrane protein  44.1 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172548  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3501  integral membrane protein  43.87 
 
 		 166 aa  105  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8067  hypothetical protein  41.03 
 
 		 178 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3005  integral membrane protein  38.31 
 
 		 172 aa  91.7  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0295794 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37820  hypothetical protein  39.74 
 
 		 186 aa  77.4  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.156933 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1394  integral membrane protein  38.51 
 
 		 170 aa  73.9  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.070776  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2147  hypothetical protein  34.12 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1828  hypothetical protein  33.52 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.47902 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0595  putative integral membrane protein  36.49 
 
 		 167 aa  67  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00342772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4162  hypothetical protein  34.03 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0836389  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6111  hypothetical protein  36.24 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0832  integral membrane protein  32.03 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000357641  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3441  hypothetical protein  33.07 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00151639  normal  0.878549 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3314  putative tricarboxylic transport membrane protein  35.25 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188099  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2146  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  32.03 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3918  putative tricarboxylic transport membrane protein  31.4 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0635614  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4256  putative tricarboxylic transport membrane protein  34.09 
 
 		 163 aa  50.8  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.313811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3335  hypothetical protein  31.88 
 
 		 163 aa  50.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.122468 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908a  hypothetical protein  33.12 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3635  hypothetical protein  31.88 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0322  hypothetical protein  30 
 
 		 192 aa  48.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751848  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3626  integral membrane protein  40.23 
 
 		 171 aa  45.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0307  putative tricarboxylic transport membrane protein  31.21 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5906  putative tricarboxylic transport membrane protein  31.01 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.896471  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1454  putative tricarboxylic transport membrane protein  30.23 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3135  hypothetical protein  36.88 
 
 		 173 aa  42  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.675068  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0997  hypothetical protein  32.18 
 
 		 219 aa  41.2  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>