43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3135 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3135  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  327  5.0000000000000004e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.675068  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3441  hypothetical protein  47.37 
 
 		 163 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00151639  normal  0.878549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3501  integral membrane protein  43.51 
 
 		 166 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3005  integral membrane protein  36.11 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0295794 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3247  integral membrane protein  35.47 
 
 		 168 aa  73.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3236  integral membrane protein  35.47 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3298  integral membrane protein  35.47 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172548  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1828  hypothetical protein  34.21 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.47902 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1235  hypothetical protein  31.97 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.422621 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2147  hypothetical protein  32.12 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8067  hypothetical protein  36.36 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3550  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3103  hypothetical protein  37.11 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531887  normal  0.721362 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3430  hypothetical protein  35.1 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784858  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3009  hypothetical protein  32.18 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.823092  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37820  hypothetical protein  38.82 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.156933 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1643  hypothetical protein  32.91 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal  0.0412546 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2568  hypothetical protein  29.49 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0024808 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2071  hypothetical protein  32.08 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.953764  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1394  integral membrane protein  32.2 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.070776  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0832  integral membrane protein  36.09 
 
 		 172 aa  52  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000357641  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4162  hypothetical protein  29.41 
 
 		 195 aa  52  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0836389  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2519  hypothetical protein  29.7 
 
 		 189 aa  51.6  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0448156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2222  hypothetical protein  38.51 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0733  hypothetical protein  38.02 
 
 		 143 aa  50.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.59707  decreased coverage  0.00107456 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3010  hypothetical protein  33.09 
 
 		 185 aa  48.5  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.313991  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0595  putative integral membrane protein  36.03 
 
 		 167 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00342772 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1362  tricarboxylic transport  35.88 
 
 		 142 aa  47.8  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3010  hypothetical protein  34.21 
 
 		 157 aa  47.8  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.238808  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6111  hypothetical protein  35.03 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3918  putative tricarboxylic transport membrane protein  32.06 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0635614  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2222  putative tricarboxylic transporter, TctB (4TM)subunit  28.57 
 
 		 172 aa  45.1  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0953872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3715  hypothetical protein  28.09 
 
 		 200 aa  45.1  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.23614 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0067  integral membrane protein  31.76 
 
 		 188 aa  44.3  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0307  putative tricarboxylic transport membrane protein  31.21 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2049  putative tricarboxylic transporter, TctB (4TM)subunit  27.78 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0136396  normal  0.392165 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5906  putative tricarboxylic transport membrane protein  31.08 
 
 		 160 aa  42.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.896471  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00850  hypothetical protein  30.88 
 
 		 186 aa  41.6  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00463032  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3579  hypothetical protein  38.14 
 
 		 648 aa  41.2  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0356555 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5628  small permease component of tripartite tricarboxylate transporter (TctB)  29.22 
 
 		 179 aa  41.2  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0322  hypothetical protein  27.22 
 
 		 192 aa  40.8  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751848  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2582  hypothetical protein  29.46 
 
 		 142 aa  40.8  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.909963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3703  hypothetical protein  36.48 
 
 		 164 aa  40.8  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>