34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3441 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3441  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  315  2e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00151639  normal  0.878549 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3135  hypothetical protein  45.65 
 
 		 173 aa  92.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.675068  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3501  integral membrane protein  38.71 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4162  hypothetical protein  35.14 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0836389  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3247  integral membrane protein  36.84 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8067  hypothetical protein  35.33 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3236  integral membrane protein  36.09 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3298  integral membrane protein  36.09 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172548  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3005  integral membrane protein  36.29 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0295794 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0832  integral membrane protein  38.28 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000357641  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2147  hypothetical protein  29.17 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1828  hypothetical protein  31.47 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.47902 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6111  hypothetical protein  30.49 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00850  hypothetical protein  32.86 
 
 		 186 aa  50.8  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00463032  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1454  putative tricarboxylic transport membrane protein  30.88 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1394  integral membrane protein  30.65 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.070776  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0733  hypothetical protein  34.62 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.59707  decreased coverage  0.00107456 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0067  integral membrane protein  30.87 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0595  putative integral membrane protein  33.06 
 
 		 167 aa  48.5  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00342772 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3550  hypothetical protein  31.08 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3430  hypothetical protein  30.08 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784858  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0307  putative tricarboxylic transport membrane protein  25.17 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37820  hypothetical protein  35.53 
 
 		 186 aa  44.3  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.156933 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5906  putative tricarboxylic transport membrane protein  26.71 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.896471  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3626  integral membrane protein  37.5 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3103  hypothetical protein  27.78 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531887  normal  0.721362 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0072  hypothetical protein  28.76 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0377393  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0396  hypothetical protein  29.79 
 
 		 183 aa  42.4  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.222332  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1235  hypothetical protein  25.86 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.422621 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5628  small permease component of tripartite tricarboxylate transporter (TctB)  31.72 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3601  hypothetical protein  38.6 
 
 		 163 aa  41.2  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243191  normal  0.0511186 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3429  hypothetical protein  31.06 
 
 		 165 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0516258 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49470  tripartite tricarboxylate transporter small hypothetical protein  34.88 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0240129  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2222  putative tricarboxylic transporter, TctB (4TM)subunit  26.32 
 
 		 172 aa  40.8  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0953872  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>