26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0595 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0595  putative integral membrane protein  100 
 
 
167 aa  318  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00342772 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1394  integral membrane protein  84.12 
 
 
170 aa  256  8e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.070776  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3247  integral membrane protein  49.04 
 
 
168 aa  147  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3236  integral membrane protein  48.41 
 
 
168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3298  integral membrane protein  48.41 
 
 
168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172548  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37820  hypothetical protein  48.8 
 
 
186 aa  130  9e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.156933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3501  integral membrane protein  45.83 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3005  integral membrane protein  44.12 
 
 
172 aa  119  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0295794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8067  hypothetical protein  39.49 
 
 
178 aa  100  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3626  integral membrane protein  60.25 
 
 
171 aa  97.1  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4162  hypothetical protein  32.74 
 
 
195 aa  78.6  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0836389  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2147  hypothetical protein  35.59 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1828  hypothetical protein  35.2 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.47902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3703  hypothetical protein  36.49 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0067  integral membrane protein  36.11 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0832  integral membrane protein  30.65 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000357641  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00850  hypothetical protein  33.58 
 
 
186 aa  62  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00463032  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3430  hypothetical protein  37.93 
 
 
157 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784858  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0322  hypothetical protein  32.59 
 
 
192 aa  54.3  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751848  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3550  hypothetical protein  33.12 
 
 
182 aa  51.2  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6111  hypothetical protein  35.85 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3441  hypothetical protein  33.06 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00151639  normal  0.878549 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3918  putative tricarboxylic transport membrane protein  29.37 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0635614  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3103  hypothetical protein  34.41 
 
 
203 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531887  normal  0.721362 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5906  putative tricarboxylic transport membrane protein  33.59 
 
 
160 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.896471  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0997  hypothetical protein  37.97 
 
 
219 aa  42  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>