26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1394 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1394  integral membrane protein  100 
 
 		 170 aa  327  5.0000000000000004e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.070776  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0595  putative integral membrane protein  84.12 
 
 		 167 aa  256  1e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00342772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3247  integral membrane protein  51.59 
 
 		 168 aa  151  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3236  integral membrane protein  50.96 
 
 		 168 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3298  integral membrane protein  50.96 
 
 		 168 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172548  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37820  hypothetical protein  48.24 
 
 		 186 aa  134  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.156933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3501  integral membrane protein  44.44 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3005  integral membrane protein  42.42 
 
 		 172 aa  114  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0295794 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3626  integral membrane protein  57.41 
 
 		 171 aa  99  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8067  hypothetical protein  38.85 
 
 		 178 aa  97.1  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4162  hypothetical protein  34.52 
 
 		 195 aa  84.3  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0836389  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1828  hypothetical protein  35.75 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.47902 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2147  hypothetical protein  36.02 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3703  hypothetical protein  38.51 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0067  integral membrane protein  38.89 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00850  hypothetical protein  32.02 
 
 		 186 aa  67  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00463032  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0832  integral membrane protein  29.77 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000357641  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0322  hypothetical protein  34.33 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751848  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6111  hypothetical protein  31.03 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3441  hypothetical protein  30.65 
 
 		 163 aa  51.2  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00151639  normal  0.878549 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3550  hypothetical protein  37.07 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3430  hypothetical protein  36.21 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784858  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3103  hypothetical protein  32.29 
 
 		 203 aa  48.5  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531887  normal  0.721362 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3918  putative tricarboxylic transport membrane protein  27.91 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0635614  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4256  putative tricarboxylic transport membrane protein  29.76 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.313811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0997  hypothetical protein  36.71 
 
 		 219 aa  41.2  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>