30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0307 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0307  putative tricarboxylic transport membrane protein  100 
 
 		 164 aa  319  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3635  hypothetical protein  64.47 
 
 		 163 aa  192  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3335  hypothetical protein  64.47 
 
 		 163 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.122468 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6111  hypothetical protein  63.16 
 
 		 164 aa  185  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4256  putative tricarboxylic transport membrane protein  63.16 
 
 		 163 aa  171  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.313811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3489  TRAP-T family transporter small inner membrane subunit  56.13 
 
 		 163 aa  141  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1419  TRAP-T family transporter small inner membrane subunit  55.48 
 
 		 163 aa  140  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218634  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3314  putative tricarboxylic transport membrane protein  57.33 
 
 		 161 aa  137  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188099  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3918  putative tricarboxylic transport membrane protein  49.61 
 
 		 165 aa  134  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0635614  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3601  hypothetical protein  37.82 
 
 		 163 aa  73.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243191  normal  0.0511186 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3074  putative tricarboxylic transport membrane protein  34.25 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.183188 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5906  putative tricarboxylic transport membrane protein  30.2 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.896471  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3430  hypothetical protein  31.45 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784858  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3550  hypothetical protein  31.45 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0362  putative tricarboxylic transport membrane protein  31.58 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3247  integral membrane protein  31.14 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37820  hypothetical protein  29.94 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.156933 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3298  integral membrane protein  30.54 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172548  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3236  integral membrane protein  30.54 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6184  putative tricarboxylic transport membrane protein  41.1 
 
 		 169 aa  51.6  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1643  hypothetical protein  28.67 
 
 		 183 aa  50.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal  0.0412546 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2071  hypothetical protein  28 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.953764  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3005  integral membrane protein  28.92 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0295794 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3441  hypothetical protein  25.17 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00151639  normal  0.878549 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0832  integral membrane protein  30.23 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000357641  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3967  hypothetical protein  23.12 
 
 		 163 aa  44.3  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0903  putative tricarboxylic transport membrane protein  25 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.530268  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0067  integral membrane protein  29.7 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4434  putative tricarboxylic transport membrane protein  25.87 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3009  hypothetical protein  24.85 
 
 		 178 aa  40.8  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.823092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>