45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3247 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3247  integral membrane protein  100 
 
 		 168 aa  319  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3236  integral membrane protein  99.4 
 
 		 168 aa  317  5e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3298  integral membrane protein  99.4 
 
 		 168 aa  317  5e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172548  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3005  integral membrane protein  70.48 
 
 		 172 aa  214  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0295794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3501  integral membrane protein  68.26 
 
 		 166 aa  214  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1394  integral membrane protein  51.59 
 
 		 170 aa  134  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.070776  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0595  putative integral membrane protein  49.04 
 
 		 167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00342772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37820  hypothetical protein  41.77 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.156933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8067  hypothetical protein  37.28 
 
 		 178 aa  97.4  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3703  hypothetical protein  44.72 
 
 		 164 aa  94.4  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0067  integral membrane protein  38.89 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1828  hypothetical protein  32.77 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.47902 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3626  integral membrane protein  46.5 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2147  hypothetical protein  32 
 
 		 198 aa  77.4  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0832  integral membrane protein  33.87 
 
 		 172 aa  77.4  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000357641  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3441  hypothetical protein  36.84 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00151639  normal  0.878549 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0322  hypothetical protein  35.56 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751848  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4162  hypothetical protein  32.1 
 
 		 195 aa  67.4  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0836389  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6111  hypothetical protein  34.55 
 
 		 164 aa  62  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00850  hypothetical protein  31.43 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00463032  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3135  hypothetical protein  39.69 
 
 		 173 aa  57.4  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.675068  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0307  putative tricarboxylic transport membrane protein  31.14 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5906  putative tricarboxylic transport membrane protein  31.45 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.896471  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4256  putative tricarboxylic transport membrane protein  33.14 
 
 		 163 aa  51.6  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.313811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3635  hypothetical protein  29.82 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5628  small permease component of tripartite tricarboxylate transporter (TctB)  26.88 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2049  putative tricarboxylic transporter, TctB (4TM)subunit  26.16 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0136396  normal  0.392165 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2222  putative tricarboxylic transporter, TctB (4TM)subunit  26.47 
 
 		 172 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0953872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2823  putative tricarboxylic transport membrane protein  34.78 
 
 		 143 aa  48.5  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3335  hypothetical protein  29.34 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.122468 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3918  putative tricarboxylic transport membrane protein  29.27 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0635614  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3197  hypothetical protein  28.4 
 
 		 170 aa  45.1  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00506023  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3122  hypothetical protein  29.46 
 
 		 162 aa  44.7  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.417087  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0733  hypothetical protein  30.19 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.59707  decreased coverage  0.00107456 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1352  membrane protein TctB, putative  26.02 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49470  tripartite tricarboxylate transporter small hypothetical protein  29.92 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0240129  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0725  putative tricarboxylic transport membrane protein  31.33 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4210  hypothetical protein  30.19 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433081 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2731  hypothetical protein  32.74 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.340219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3314  putative tricarboxylic transport membrane protein  31.4 
 
 		 161 aa  42  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188099  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03720  conserved hypothetical protein  30.19 
 
 		 169 aa  42  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03669  hypothetical protein  30.19 
 
 		 168 aa  41.6  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3050  small permease component of tripartite tricarboxylate transporter  28.67 
 
 		 196 aa  41.6  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0820746  normal  0.460517 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3967  membrane protein TctB, putative  24.39 
 
 		 152 aa  41.2  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.605379  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4233  membrane protein TctB, putative  25.66 
 
 		 152 aa  41.2  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>