13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2049 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2049  putative tricarboxylic transporter, TctB (4TM)subunit  100 
 
 		 176 aa  359  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0136396  normal  0.392165 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2222  putative tricarboxylic transporter, TctB (4TM)subunit  80.68 
 
 		 172 aa  286  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0953872  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2147  hypothetical protein  27.43 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3236  integral membrane protein  26.16 
 
 		 168 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3298  integral membrane protein  26.16 
 
 		 168 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172548  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3247  integral membrane protein  26.16 
 
 		 168 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3488  hypothetical protein  25.3 
 
 		 163 aa  47.8  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.916647  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1959  hypothetical protein  34.95 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.202107  normal  0.64618 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3501  integral membrane protein  26.43 
 
 		 166 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.33628 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03720  conserved hypothetical protein  27.49 
 
 		 169 aa  41.6  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4210  hypothetical protein  27.49 
 
 		 168 aa  41.2  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433081 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03669  hypothetical protein  27.49 
 
 		 168 aa  41.2  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1828  hypothetical protein  26.88 
 
 		 204 aa  41.2  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.47902 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>