14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_03669 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03720  conserved hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  335  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03669  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  335  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4210  hypothetical protein  99.4 
 
 
168 aa  333  5e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433081 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2049  putative tricarboxylic transporter, TctB (4TM)subunit  27.49 
 
 
176 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0136396  normal  0.392165 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0299  hypothetical protein  26.49 
 
 
150 aa  47  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2222  putative tricarboxylic transporter, TctB (4TM)subunit  29.63 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0953872  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4162  hypothetical protein  24.84 
 
 
195 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0836389  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3236  integral membrane protein  29.75 
 
 
168 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3298  integral membrane protein  29.75 
 
 
168 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172548  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2147  hypothetical protein  23.89 
 
 
198 aa  44.7  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1852  hypothetical protein  27.46 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.946732 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3247  integral membrane protein  29.11 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3005  integral membrane protein  26.06 
 
 
172 aa  42.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0295794 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3967  hypothetical protein  26.85 
 
 
163 aa  40.8  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>