17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1852 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1852  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  320  7e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.946732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2025  hypothetical protein  66.67 
 
 		 165 aa  207  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0928756  normal  0.256497 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3429  hypothetical protein  66.67 
 
 		 165 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0516258 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2228  hypothetical protein  49.09 
 
 		 166 aa  150  7e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0483  hypothetical protein  45.16 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5628  small permease component of tripartite tricarboxylate transporter (TctB)  40 
 
 		 179 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3099  hypothetical protein  40.79 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0825077  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4225  hypothetical protein  39.26 
 
 		 166 aa  104  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.360299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3082  hypothetical protein  43.71 
 
 		 176 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.583252  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4492  hypothetical protein  38.92 
 
 		 199 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36150  hypothetical protein  43.11 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000272635 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2796  hypothetical protein  38.61 
 
 		 173 aa  99.8  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.825323  normal  0.0868424 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3050  small permease component of tripartite tricarboxylate transporter  40.99 
 
 		 196 aa  97.1  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0820746  normal  0.460517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5725  hypothetical protein  34.57 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0156863  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2074  hypothetical protein  27.11 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1219  hypothetical protein  31.03 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0261954  normal  0.740843 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0092  hypothetical protein  26.75 
 
 		 169 aa  40.8  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>