17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2228 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2228  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  321  3e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1852  hypothetical protein  49.09 
 
 		 165 aa  150  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.946732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2025  hypothetical protein  54.14 
 
 		 165 aa  147  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0928756  normal  0.256497 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3429  hypothetical protein  54.89 
 
 		 165 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0516258 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0483  hypothetical protein  45.29 
 
 		 171 aa  141  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4492  hypothetical protein  49.26 
 
 		 199 aa  127  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4225  hypothetical protein  40.24 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.360299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36150  hypothetical protein  42.59 
 
 		 176 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000272635 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3082  hypothetical protein  42.59 
 
 		 176 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.583252  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3099  hypothetical protein  39.02 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0825077  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5628  small permease component of tripartite tricarboxylate transporter (TctB)  40.24 
 
 		 179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2796  hypothetical protein  41.72 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.825323  normal  0.0868424 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3050  small permease component of tripartite tricarboxylate transporter  45.86 
 
 		 196 aa  107  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0820746  normal  0.460517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5725  hypothetical protein  35.58 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0156863  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1219  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0261954  normal  0.740843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2074  hypothetical protein  26.04 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  32 
 
 		 404 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>