16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0483 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0483  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  343  6e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2228  hypothetical protein  45.29 
 
 		 166 aa  141  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2025  hypothetical protein  43.79 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0928756  normal  0.256497 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3429  hypothetical protein  43.79 
 
 		 165 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0516258 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1852  hypothetical protein  45.16 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.946732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4492  hypothetical protein  47.06 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5628  small permease component of tripartite tricarboxylate transporter (TctB)  43.6 
 
 		 179 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2796  hypothetical protein  38.69 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.825323  normal  0.0868424 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5725  hypothetical protein  38.92 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0156863  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3050  small permease component of tripartite tricarboxylate transporter  44.78 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0820746  normal  0.460517 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3099  hypothetical protein  35.4 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0825077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36150  hypothetical protein  36.59 
 
 		 176 aa  101  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000272635 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3082  hypothetical protein  36.09 
 
 		 176 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.583252  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4225  hypothetical protein  34.9 
 
 		 166 aa  87.4  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.360299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1219  hypothetical protein  28.57 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0261954  normal  0.740843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2074  hypothetical protein  25 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>