18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4492 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4492  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  397  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2796  hypothetical protein  67.24 
 
 		 173 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.825323  normal  0.0868424 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2228  hypothetical protein  46.67 
 
 		 166 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0483  hypothetical protein  43.9 
 
 		 171 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5628  small permease component of tripartite tricarboxylate transporter (TctB)  43.27 
 
 		 179 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3099  hypothetical protein  43.87 
 
 		 166 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0825077  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4225  hypothetical protein  41.61 
 
 		 166 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.360299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3050  small permease component of tripartite tricarboxylate transporter  43.07 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0820746  normal  0.460517 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3429  hypothetical protein  44.17 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0516258 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1852  hypothetical protein  40.12 
 
 		 165 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.946732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2025  hypothetical protein  41.61 
 
 		 165 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0928756  normal  0.256497 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36150  hypothetical protein  40.36 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000272635 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3082  hypothetical protein  37.43 
 
 		 176 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.583252  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5725  hypothetical protein  34.83 
 
 		 180 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0156863  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1219  hypothetical protein  31.54 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0261954  normal  0.740843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2074  hypothetical protein  26.8 
 
 		 169 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2502  hypothetical protein  30.66 
 
 		 303 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0092  hypothetical protein  27.61 
 
 		 169 aa  42.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>