16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3429 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3429  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  318  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0516258 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2025  hypothetical protein  90.91 
 
 		 165 aa  280  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0928756  normal  0.256497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1852  hypothetical protein  66.67 
 
 		 165 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.946732 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2228  hypothetical protein  51.66 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0483  hypothetical protein  43.79 
 
 		 171 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3082  hypothetical protein  45.29 
 
 		 176 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.583252  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3099  hypothetical protein  42.07 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0825077  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4492  hypothetical protein  44.93 
 
 		 199 aa  114  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36150  hypothetical protein  43.53 
 
 		 176 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000272635 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5628  small permease component of tripartite tricarboxylate transporter (TctB)  38.82 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2796  hypothetical protein  39.88 
 
 		 173 aa  110  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.825323  normal  0.0868424 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4225  hypothetical protein  40.85 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.360299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3050  small permease component of tripartite tricarboxylate transporter  39.35 
 
 		 196 aa  100  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0820746  normal  0.460517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5725  hypothetical protein  34.84 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0156863  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2074  hypothetical protein  28.1 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1219  hypothetical protein  31.2 
 
 		 161 aa  52  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0261954  normal  0.740843 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>