16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4225 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4225  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  326  8e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.360299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3099  hypothetical protein  68.07 
 
 		 166 aa  226  9e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0825077  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2228  hypothetical protein  40.24 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3050  small permease component of tripartite tricarboxylate transporter  41.72 
 
 		 196 aa  115  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0820746  normal  0.460517 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4492  hypothetical protein  40.99 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5628  small permease component of tripartite tricarboxylate transporter (TctB)  34.15 
 
 		 179 aa  107  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1852  hypothetical protein  39.26 
 
 		 165 aa  104  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.946732 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2796  hypothetical protein  37.42 
 
 		 173 aa  103  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.825323  normal  0.0868424 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2025  hypothetical protein  40.85 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0928756  normal  0.256497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3082  hypothetical protein  39.63 
 
 		 176 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.583252  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36150  hypothetical protein  39.02 
 
 		 176 aa  97.4  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000272635 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3429  hypothetical protein  40.85 
 
 		 165 aa  94.4  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0516258 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5725  hypothetical protein  34.36 
 
 		 180 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0156863  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0483  hypothetical protein  34.9 
 
 		 171 aa  87.4  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1219  hypothetical protein  26.39 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0261954  normal  0.740843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2074  hypothetical protein  24.67 
 
 		 169 aa  41.2  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>