17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2796 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2796  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  341  2.9999999999999997e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.825323  normal  0.0868424 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4492  hypothetical protein  67.24 
 
 		 199 aa  224  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0483  hypothetical protein  38.69 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2228  hypothetical protein  41.72 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5628  small permease component of tripartite tricarboxylate transporter (TctB)  34.97 
 
 		 179 aa  104  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4225  hypothetical protein  37.42 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.360299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3099  hypothetical protein  40.13 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0825077  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1852  hypothetical protein  38.61 
 
 		 165 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.946732 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3429  hypothetical protein  39.88 
 
 		 165 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0516258 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3050  small permease component of tripartite tricarboxylate transporter  40 
 
 		 196 aa  97.4  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0820746  normal  0.460517 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2025  hypothetical protein  37.97 
 
 		 165 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0928756  normal  0.256497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5725  hypothetical protein  38.71 
 
 		 180 aa  88.6  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0156863  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36150  hypothetical protein  38.18 
 
 		 176 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000272635 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3082  hypothetical protein  36.6 
 
 		 176 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.583252  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1219  hypothetical protein  28.19 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0261954  normal  0.740843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2074  hypothetical protein  25.44 
 
 		 169 aa  51.6  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2502  hypothetical protein  34.11 
 
 		 303 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>