23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4162 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4162  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  368  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0836389  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1828  hypothetical protein  42.52 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.47902 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2147  hypothetical protein  42.18 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00850  hypothetical protein  36.56 
 
 		 186 aa  98.6  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00463032  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0322  hypothetical protein  38.38 
 
 		 192 aa  95.5  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751848  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1394  integral membrane protein  33.93 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.070776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8067  hypothetical protein  29.71 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0595  putative integral membrane protein  32.34 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00342772 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3441  hypothetical protein  35.14 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00151639  normal  0.878549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3501  integral membrane protein  35.94 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3247  integral membrane protein  32.1 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3298  integral membrane protein  32.1 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172548  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3236  integral membrane protein  32.1 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0832  integral membrane protein  33.87 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000357641  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0997  hypothetical protein  33.52 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3626  integral membrane protein  52.46 
 
 		 171 aa  60.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3005  integral membrane protein  35.94 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0295794 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37820  hypothetical protein  31.93 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.156933 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3430  hypothetical protein  30.95 
 
 		 157 aa  45.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784858  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6111  hypothetical protein  28.81 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0067  integral membrane protein  28.93 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3550  hypothetical protein  30.51 
 
 		 182 aa  42.4  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3135  hypothetical protein  38.46 
 
 		 173 aa  41.2  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.675068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>