29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2147 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2147  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  378  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1828  hypothetical protein  51.96 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.47902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4162  hypothetical protein  44.69 
 
 		 195 aa  118  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0836389  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8067  hypothetical protein  35.08 
 
 		 178 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0322  hypothetical protein  36.41 
 
 		 192 aa  86.3  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751848  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00850  hypothetical protein  34 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00463032  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3247  integral membrane protein  32 
 
 		 168 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3236  integral membrane protein  31.43 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3298  integral membrane protein  31.43 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172548  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3501  integral membrane protein  35.53 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1394  integral membrane protein  34.95 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.070776  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3005  integral membrane protein  31.11 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0295794 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0595  putative integral membrane protein  35.23 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00342772 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3441  hypothetical protein  29.17 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00151639  normal  0.878549 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0832  integral membrane protein  31.65 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000357641  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3103  hypothetical protein  30.63 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531887  normal  0.721362 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3626  integral membrane protein  43.04 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37820  hypothetical protein  29.02 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.156933 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0997  hypothetical protein  32.23 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2049  putative tricarboxylic transporter, TctB (4TM)subunit  27.43 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0136396  normal  0.392165 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0067  integral membrane protein  26.11 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2222  putative tricarboxylic transporter, TctB (4TM)subunit  26.29 
 
 		 172 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0953872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3135  hypothetical protein  33.11 
 
 		 173 aa  49.3  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.675068  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3430  hypothetical protein  29.45 
 
 		 157 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784858  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3703  hypothetical protein  33.53 
 
 		 164 aa  45.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6111  hypothetical protein  29.05 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3550  hypothetical protein  30 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3918  putative tricarboxylic transport membrane protein  33.82 
 
 		 165 aa  43.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0635614  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5906  putative tricarboxylic transport membrane protein  28.32 
 
 		 160 aa  43.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.896471  normal  0.308497 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>